・どこまで論文を深く読めばいいのかわからない ・人によって論文の読み方が違っていてどうすればいいのだろう ・研究デザインや統計学の本を読んだけど実際の論文は読めない ・統計解析の部分は飛ばしているけど何をしているか知りたい 誰もが一度はこのように思ったことがあるはず。 実は「臨床研究論文の唯一の正しい読み方」というのはありません。研修医も指導医も、それぞれのレベルで理解し、それぞれの立ち位置...

**日本のイノベーション政策の中に科学はない 　ー科学にも実用志向が求められるようになりました。生命科学は薬剤設計に反映しやすく、基礎と応用が両立しやすい分野です。 　「生物学が医学に従属してしまった。医...

臨床研究論文の書き方・進め方のサイトです

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１. イシューからはじめよ 臨床研究に限った事ではないのですが、「問いを正しく立てる」というのは非常に重要です。筆者がお勧めの動画として、下記のTED talkがあります。日本語で10分ほどなので是非見てください。この安宅さんの「イシューか

本書は,統計的因果推論の理論(数理的メカニズム)と実装(Rによる数値解析)の両方を統一的にカバーしたものである。具体的には,ハーバード大学統計学科のDonald B. Rubinの提唱した潜在的結果変数の枠組みによる統計的因果推論を扱う。また,データの一部が観測されない場合の因果推論も扱っており,これは類書にはほとんどみられない本書の特徴である。 本書の数理的な理論解説は,できるだけ高校数学...

臨床研究に必要なところだけコンパクトに解説! 統計の基本を読みながら,付属のサンプルデータを使い29の課題に沿って実際にデータ解析をやってみることで,難しいと思っていた医療統計もすんなりわかる. 【目次】 序文 サンプルデータダウンロードのご案内 講義編 講義編を読む前に 第1章 私たちは,なぜ臨床研究をするのか? 第2章 臨床研究はどう行う? 〜CQから統計解析・論文作成まで 第3章...

症例報告の書き方ポイント ChatGPTと症例報告を書く 症例報告の手順と同意

１. Tableがなぜ必要か 臨床研究というのは母集団からサンプルを取ってきて推測を行いますが、Tableは得られたサンプルの情報（記述統計）と推定結果（推測統計）を示すために必要になります。臨床研究であれば、一つの論文に3個程度が理想と思

元々は大学院の授業レポートでまとめた内容ですが、折角なので弁護士に相談して公開できる内容にしました。ただ、常に明瞭に線引きがあるわけではありません。個々の規約や倫理的側面、「常識的なこと」に十分に配慮ください。著作権の領域は実際の当てはめも非常に難しいため、法律家でも判断が分かれることはよくあるとのことでした。 ※内容に誤りがある場合、https://twitter.com/GtoDrまで連...

今でもよく覚えているのですが、慶応大学の理工学部一年目だった時のこと。 選択科目で旋盤を使って金属を加工するという実習課題がありました。旋盤が何なのかよくわからないまま言われた通りに作業をし、「金属が簡単に加工できる、すごい!!」と思いながら、課題を行ったあと誰よりも早く一番にレポートをその場で書いて提出しました。 レポートなので考察・結論的な部分があったのですが、 「旋盤の技術はすごいなと...

Research idea briefing sheet 結局はほぼメンターが全てであるとはいえ、実際に論文指導しているとよく行き詰まる点があります。 論文として言いたいことが不明瞭 解析は終えているがメッセージが決まらない 結果とメッセー

2024年1月にBMJのResearch Methods & Reportingで予測モデルの評価と外的検証に関するreviewが3本出たので、復習も兼ねて自分なりに整理しました。本記事ではpart 1のみ扱っています。 この論文に書いてある通りに行うべき・論ずるべきか？と言われると思うところはあるのですが、予測モデルの研究を行った経験のある人や、抄読会などで何度か予測モデルの研究を扱った人...

・どこまで論文を深く読めばいいのかわからない ・人によって論文の読み方が違っていてどうすればいいのだろう ・研究デザインや統計学の本を読んだけど実際の論文は読めない ・統計解析の部分は飛ばしているけど何をしているか知りたい 誰もが一度はこのように思ったことがあるはず。 実は「臨床研究論文の唯一の正しい読み方」というのはありません。研修医も指導医も、それぞれのレベルで理解し、それぞれの立ち位置...

近年の臨床研究手法は凄いスピードで進化していて、多くの臨床家にとって遠いものになりつつあるのではないかという気がしています。これは大規模データベースの登場、マルチモダリティデータ（テキスト、画像、遺伝子…）、疫学生物統計学の発展、AIの登場など複合的な要因がありますが、この傾向はますます加速していくでしょう。 臨床研究を行っている人の中には「少し前までは、これくらいのデータでこういう研究でも...

Having benefited from excellent mentors over the course of her career, a physician concludes that a true mentor is someone who has more imagination about you than you have about yourself.

学生の時、学会シーズンになると行われる「予演会」が嫌いでした。定例カンファの後に追加で行われるから帰るのが遅くなるし、内容は専門的すぎて面白いのか分からないので。今では凄く大事だなと実感しています。 今回の集中治療学会では3名の学生・研修医が発表しましたが、一名は優秀演題セッションに採択されて良かったです。一名は事前のスライド供覧を忘れてたので注意しました。 SPY×FAMILY /...

先日、救急専門医を持っている4名（一人は蘇生のエキスパート）でピッツバーグの大久保先生が書いたBMJの院内心停止に関する論文を読みました。院内心停止はどの科でも起こりうる事象ですが、蘇生時間が30分〜40分を超えると予後は厳しいということが改めて可視化された論文です。 大久保先生は僕が研修医時代からお世話になっている先生で、EM Allianceなどのイベント通じて色々と教えていただきました...

なぜ研究テーマに困るのか 研究テーマ決めに関しては、指導者からテーマをもらう時にはあまり困らない一方、自分で研究案を練るときに結構困ることがあります。一番大事なところであり、一番面白いところであり、一番難しいところでもあります。 研究室所属

なぜキャリアや業績を可視化するのか 昨今はSNSなどを介して色々な案件が舞い込んだり、共同研究の話が進むことは少なくありません。これまで学会などが担っていた部分であるとは思いますが、特に横断的な領域の人や学際的な人にとっては自分のキャリアを可視化していくことが自分の将来につながる可能性があります。 SNSで繋がった人との共同研究などもよく耳に（目に？）します。 一方で色々情報過多になりやすい...

昨日のTXP勉強会ではAJRCCM（集中治療のトップジャーナル、通称ブルージャーナル）のin pressの論文を紹介してもらいました。発表者の先生は論文の見た目に拘る派で、どうやって綺麗な図表を描くか、なども見て自分の研究に生かしているとのこと。すごい。 僕もどちらかというとそのタイプで、図表が汚い・雑な論文が回ってくると「どうせ中身も適当だろうな」と思ってしまうのですが、今回紹介してもらっ...

Nature - Machine-learning tools can correct grammar and advise on the style and tone of presentations — but they must be used with caution.

“論文を読んで理解する"ということはどういうことか.本書は,そんな問いに答えてくれます.これまで一度も論文を書いた経験のない人でも,論文に対するコメントを“Letter"として投稿することで,ただ論文を読んで終わる「読み方1.0」から,読んだ論文を解釈し文章にすることで理解する「読み方2.0」へ進化させることができます.その具体的な方法について,成功例や失敗例など実際の事例を紹介しながら詳し...

１. 読みやすいレスポンスレターを書く 査読コメントに対応するのは中々辛い作業ですが、基本的には順番に対応していきましょう。時には何回も同じことを説明する必要があり、その時には「上記に書いた通り~」と書けますし、査読者も重要な点から順番にコ

献本いただきました。お世話になっている先生方が書かれているのですが、できるだけ率直に書いていきます。 結論からいうと完全な入門書ではないため、タイトルに「より深く」とある通り、入門書の次に手に取るのが良いと思います。特に回帰分析をよく用いる先生は手に取って損はないでしょう。11-16が出色に思いました。最低限の因果推論の知識はあった方が良いです。 生物統計学の道標 研究デザインから論文報告ま...

１. 論文のお作法は必ず押さえる 論文執筆においてお作法は非常に大事です。なぜ大事かというと、お作法がなっていない論文が査読に回ってくると「ああ、ちゃんとした指導を受けていないんだな。論文の内容も適当そうだな」と思われてしまい、いい事はあり

僕が留学した10年ほど前にはSTATAかRかPythonか、という感じでしたが、今はもうRとPythonでいいでしょう。STATAが流行した際にはSPSSなんて…という人も多かった気がしますが、今はSTATAがその位置にあります。当時SPSSやSASは古いと言ってSTATA使っていた人は気をつけてください笑（弘法筆を選ばずですし、結果が出ればなんでもいいとは思うのですが） 超入門！　すべての...

TXP Research FESTA

TXP Research FESTA

出版からもうすぐ3年になろうとしている本書ですが、5刷の連絡を頂きました。地道に売れ続けているのは嬉しいもので、折角なので本書を出したことを振り返ろうと思います。手に取って頂いた方には本当に感謝しています。 僕らはまだ、臨床研究論文の本当の読み方を知らない。〜論文をどう読んでどう考えるか amzn.to 3,960円 (2023年12月30日 22:55時点 詳しくはこちら) Amazon....

１. 論文のお作法は必ず押さえる 論文執筆においてお作法は非常に大事です。なぜ大事かというと、お作法がなっていない論文が査読に回ってくると「ああ、ちゃんとした指導を受けていないんだな。論文の内容も適当そうだな」と思われてしまい、いい事はあり

書籍『膨大な医学論文から最適な情報に最短でたどり着くテクニック』の刊行を記念し、著者の重見大介先生、岩上将夫先生がご解説！著者らが実際に行っている一歩踏み込んだ検索をレクチャーします。本書を読んで、この動画をチェックしたら、ぜひご自分の検索にトライしてみてください！著者重見大介先生（東京大学大学院 医学系研究科 ...

本日はTXPリサーチフェスタという場で講演の場を与えていただきました。 お題は「Physician-scien…

献本いただきました。臨床疫学の専門家の先生方が書かれている因果推論の入門書です。著者を見ただけで、「あ、これは買おう」と思う人もそれなりにいると思います。 因果推論は流派や考え方などもあってディープな分野なので、僕の本ではさらっと流すにとどめていましたが（因果警察怖いし）、最近はEpiTapなどの因果推論セミナーがあり、医療者にも浸透してきたと思います。その部分に正面から切り込んでいった本です。...

Nature - A study of review reports identifies dozens of adjectives that could indicate text written with the help of chatbots.

TXP Medicalの医療データサービスは、全診療科を対象とした構造化カルテテキスト＋検査値＋DPCを用いたデータ解析により、製薬企業のメディカル・アフェアーズ部門をはじめ、臨床研究に関わる方々の医療実態調査やデータベース研究活動をご支援いたします。臨床研究の原著論文を数多く出している医師を中心としたリサーチチーム「TXP Research」を有し、臨床経験に加えて機械学習/AI、公衆衛生...

TXP Medical株式会社（本社：東京都千代田区 以下TXP Medical）は、この度、株式会社未来医療研究センター（本社：東京都千代田区）との連携により、製薬企業や医療機器メーカー向けの新たな... 

2022年から現在まで、横浜市立大学ヘルスデータサイエンス(HDS)専攻清水研究室の客員講師として研究指導を行っています。 YCU 横浜市立大学 データサイエンス研究科 ヘルスデータサイエンス専攻 ヘルスデータサイエンス専攻のご案内ページです。ヘルスデータサイエンス専攻は、医学部とデータサイエンス学部を併せ持つ国内唯一 www-user.yokohama-cu.ac.jp 横浜HDSで修士（...

医薬品に関する臨床系論文の読み方 ランダム化比較試験からリアルワールドデータ研究まで

Background: Despite the increasing availability of clinical decision support systems (CDSSs) and rising expectation for CDSSs based on artificial intelligence (AI), little is known about the accept...

Part 1の概要と解説記事はこちらからどうぞ。 今回はそのPart2に関してまとめました（CC BY 4.0） Riley RD, Archer L, Snell KIE, Ensor J, Dhiman P, Martin GP, Bonnett LJ, Collins GS. Evaluation of clinical prediction models (part 2): how to...

夏になって海や川での事故が相次いでいます。海は綺麗だし、色々な生き物がいるし、楽しいですよね。僕は釣り・素潜り・ダイビングが大好きです。父親や祖父と釣りに行ったり、漁協が許可している地域でアワビやサザエを取って遊んだりしていました。食べるのは好きじゃないので主に獲る専門ですが、岩の間にいるアワビの大物を見つけた時はめちゃくちゃテンション上がります（密猟はダメ、絶対）。 海で遊ぶ中で何度か溺れ...

医師と一緒に仕事や研究をしていると、よく平日夜や週末にミーティングが行われます。僕もそれが当たり前だと思っていましたし、実際に今も夜に固定時間のミーティングがあります。そもそも数人レベルでも時間を合わせるのが難しいのに、何十人もが日中に固定時間の会議枠を取るというのはまず無理なので。 医師から『スケジューラー作ったんでお願いしますー』ってメールやSlackで連絡が来ると、平気で夕方19時〜、...

TXP Medical株式会社のプレスリリース（2023年9月12日 11時00分）メディカル・データ・ビジョンとTXP Medical業務提携

臨床研究論文作成マニュアルのPDF版です