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叢雲くすり (創薬ちゃん)

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叢雲くすり (創薬ちゃん)

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💊創薬知ゃんボット (α) 放流💊 勢いで作ってみた。創薬に関わる質問を投げてもらったら可能な範囲で答えるぞ。ネットのおもちゃにしてくれていいので遊んでみるといい。(※ 遊ばれ過ぎると私のポケットマネー課金リミットで止まる) お手柔らかにどうぞ❤️‍🔥❤️‍🔥❤️‍🔥 友だち登録 →

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3 years

・初回接種後しばらくはまだ免疫はついていないから気を緩めてはいけない・２回接種で抗体価は何倍にもなる(のでやはり２回打ちしたほうがいい) というのが分かるように身体を張って何十回もセルフ採血してグラフで可視化した(n=1だが)ので周りへの説明や説得に使ってくれていいぞ！ #コロナワクチン

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3 years

続き！接種後デイリーセルフ採血 10 週間フォローアップ。 (n = 1) 初回接種後のピーク値よりは高いがブースト後のピーク値の 1/3 を少し下回ったくらいの値で横ばいへ。

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3 years

・初回接種後しばらくはまだ免疫はついていないから気を緩めてはいけない・２回接種で抗体価は何倍にもなる(のでやはり２回打ちしたほうがいい) というのが分かるように身体を張って何十回もセルフ採血してグラフで可視化した(n=1だが)ので周りへの説明や説得に使ってくれていいぞ！ #コロナワクチン

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3 years

時々まだ用語の混同を見掛けるので貼っておこう。

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7 months

大規模言語モデルほど大量のデータを食わなくても子供は言語を獲得する。それをニューラルネットで再現できるか確認するため、赤ちゃん１人の頭に生後 6〜25 ヶ月の間に録画用ビデオを延べ 61 時間装着して音声･映像データを取得、マルチモーダル学習を成功させたとする報告、Science。 Congrats！👏

@wkvong

Wai Keen Vong

7 months

1/ Today in Science, we train a neural net from scratch through the eyes and ears of one child. The model learns to map words to visual referents, showing how grounded language learning from just one child's perspective is possible with today's AI tools.

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3 years

ワクチン接種後抗体��セルフモニタリング定例報告。(n = 1) ある程度サンプル数を集めた抗体価フォローアップ調査結果がここ最近いくつか報告されて来ているが、それらと概ね傾向は一致する典型的な減衰カーブ。免疫記憶によって守られ続けてはいるはずだが、引き続きできる限りの防疫を継続する。

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3 years

続き！接種後デイリーセルフ採血 10 週間フォローアップ。 (n = 1) 初回接種後のピーク値よりは高いがブースト後のピーク値の 1/3 を少し下回ったくらいの値で横ばいへ。

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3 years

💉フル○ンなう💉 に使っていいぞ！ (アイコン用透過 PNG) ※ 各ワクチン規定の期間が経ってから装着すること #FullyVaccinated #コロナワクチン

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3 years

My 1st shot of tozinameran (COMIRNATY®: Pfizer–BioNTech COVID-19 vaccine). #igotmyshot #COVIDVaccination 接種した。せっかくなので連日採血して抗体価の変化を見ていこうと思う。 #day_0

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3 years

百年前ですら既に推奨されていたインフルエンザ感染予防策。・マスク着用・清潔、衛生・手洗い・換気・よく寝る・人ごみを避ける、風邪っぽい人を避ける・自分に理解できないからといって専門家の言うことを軽視しない・自分には特権があると思うなほか #基本が大事

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Article clipped from Douglas Island News

Clipping found in Douglas Island News published in Douglas, Alaska on 11/15/1918.

www.newspapers.com

@AmyGDalaMD

Amy G Dala MD

3 years

Flu prevention recommendations from 1918 newspaper 😳😢😭

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3 years

💊Happy Valentine's Day！💊 恒例の。ブースター接種後デイリー採血抗体価フォローアップ (n = 1)。接種４日後あたりから抗体価が立ち上がり始め、１週間程度で２回目接種後のピーク値と同等程度の水準のピーク値となった。 #FullyVaccinated + #Boosted = #UpToDate #GetVaccinated #blockbustART

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3 years

Antibody titer follow-up for 8 months (n=1). 抗体価の経時的な低下はもはや周知の事実で特に目新しさも無いと思うが、接種後８ヶ月経過ということで久しぶりにセルフ採血データ最新版。創薬アドベントカレンダー () 記事を兼ねて: #souyakuAC2021

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1 year

感染流行下、マスクをしてくれているみなさんへお互いのためにマスクをしてくれてありがとうあとこのへんを直してもらえれば完璧です･人前で咳やクシャミをする時に敢えて外す･会話する時にずらすせっかく着けていても飛沫を出す時に外すと意味が無いですよろしくお願いしますわたしより

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3 years

利用しやすいように登録しておいた！ iconDecotter | [I GOT VACCINATED ワクチン接種済マーク] | あなたのTwitterアイコンをデコレーション！アイコンデコッター version P version M #iconDecotter #FullyVaccinated

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2 years

発注した。ちょっと成分分析してみようと思う。

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@MIKITO_777

知念実希人【公式】

2 years

感度が低い『研究用』抗原検査キットで荒稼ぎした東亜産業が今度は、『吸入抗体』というゴミを販売します。抗体は特異的に効果を示すもので、SARS-Cov2抗体でないこれに感染予防効果は皆無です。しかも見えないくらい小さな文字で『予防効果はない』と書く始末…… 絶対に買わないで下さい。

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3 years

バズっているのでついでに HPV ワクチンも推しておこう！早々に９価を打って自費で十万かかったが、これも是非装備しておきたい免疫だ。（こっちの抗体価測定はしていない）

@souyakuchan

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3 years

みんなも打つといい💉

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@souyakuchan

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3 years

株によらず発症・重症化の予防効果は長めに続きそうという知見は確立されてきているが、無症候感染を含む感染自体の予防効果が経時的にどうなっていくかについては、抗体価低下や変異による相対的な力価の低下が加わると心許ないところがある。流行っている間は感染対策は怠らないほうが無難だろう。

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@souyakuchan

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3 years

接種後の日々の経過のツリーもぶら下げておこう

@souyakuchan

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3 years

My 1st shot of tozinameran (COMIRNATY®: Pfizer–BioNTech COVID-19 vaccine). #igotmyshot #COVIDVaccination 接種した。せっかくなので連日採血して抗体価の変化を見ていこうと思う。 #day_0

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@souyakuchan

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2 years

この謝辞がすごい 2023: 「1987 年以来私の申請を全てリジェクトしてくれてありがとう米国国立科学財団。おかげでグラントを更新する必要も獲得する見込みも無かったので、好奇心のみで科学を探求できた。」 J. I. Katz Prof. of Physics, Wash U.

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Jonathan I Katz

Professor of Physics, Washington University - Cited by 9,628 - astrophysics - plasma physics - applied physics - climate - soft matter

scholar.google.com

@Sayan_Quantum

Sayan Choudhury

2 years

Best Acknowledgment ever! “ The author thanks the U. S. NSF for rejecting every proposal he has submitted since 1987. Not needing to renew grant support and with little prospect of obtaining it, he has been free to pursue curiousity-driven science.” Source: arXiv: 2302.00738

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2 years

講義の難易度が高過ぎるとして学生の署名を受けて先日クビにされたジョーンズ有機化学のジョーンズ教授本人による、近年の学生の姿勢の変化を嘆く述懐。

@GlobeOpinion

Boston Globe Opinion

2 years

Teachers must have the courage to assign low grades when students do poorly without fear of punishment — and students need to develop the ability to take responsibility for failure, writes Maitland Jones Jr.

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3 years

CDC 勧告「デルタの猛威。流行っているエリアでは接種済みであってもマスクはつけるべき」

@CDCgov

CDC

3 years

#DeltaVariant surging in U.S. New data show Delta much more contagious than previous versions of #COVID19 . Unvaccinated people: get vaccinated & mask until you do. Everyone in areas of substantial/high transmission should wear a mask, even if vaccinated.

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3 years

時々ひどい言説が報道されるたびに引用が増えるツイート

@souyakuchan

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3 years

・初回接種後しばらくはまだ免疫はついていないから気を緩めてはいけない・２回接種で抗体価は何倍にもなる(のでやはり２回打ちしたほうがいい) というのが分かるように身体を張って何十回もセルフ採血してグラフで可視化した(n=1だが)ので周りへの説明や説得に使ってくれていいぞ！ #コロナワクチン

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7 years

おくすりタワーバトル

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3 years

「現行版ワクチンが効かない variant はいずれ出てくるだろう、だが出てきたとしても３ヶ月でそれに対応したワクチンを作れる」Pfizer CEO 談。

@therecount

The Recount

3 years

Pfizer CEO Dr. Albert Bourla says that a vaccine-resistant COVID variant will “likely” emerge.

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2 years

ブースター接種後 14 日後など定点観測データの報告は比較的よく見かけるのだが、１日単位で抗体価を追って約何日目にどの程度上がるのかを調べたデータが意外と世の中に存在しないので微更新と共に再掲しておく。私の場合はブースター接種後 12 日程度でピークに達していた (やや測定値のブレあり)。

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3 years

💊Happy Valentine's Day！💊 恒例の。ブースター接種後デイリー採血抗体価フォローアップ (n = 1)。接種４日後あたりから抗体価が立ち上がり始め、１週間程度で２回目接種後のピーク値と同等程度の水準のピーク値となった。 #FullyVaccinated + #Boosted = #UpToDate #GetVaccinated #blockbustART

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2 years

遺伝子検査で希少がんのドライバー変異を特定し、標準治療を越えて自ら進んで治験薬の被験者となり見事に薬が奏功していたのはさすが生粋の創薬科学者だった。2019 年に承認薬となっており、まさに彼のデータは今も生きている。

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3 years

@sknn @concert_1750 昨日 Pfizer が出したデータ()によると、２回打ってあると、追加でもう一度打った時には２回接種後のさらに５～１０倍以上に抗体が上がるようです。つまり、ブレークスルー感染した時の免疫反応も、１回打ちより２回打ちしてあったほうが何倍も強いと考えられます。(続

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

@sknn @concert_1750 つまり、１回打ちで抗体価が（２回打ちしてしばらく経って抗体価が下がってきた人と比べて）半分程度はあるように見えても、実質的には半分も守られていないことがあり得ます。少なくともデルタ等VOCに対しては１回打ちでは不十分と分かっています。１回打ちでは不足であると思ったほうがよいです。(終

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叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

バズっているグラフ、n=1なので参考程度にというのは間違いないが、接種前後等の定点観測採血で抗体価が概ね同様に振舞うというのは既にさんざん報告があり、このグラフの推移の傾向自体は当たり前体操なので既知エビデンスと思っていい（間の時系列を埋めたから見た目上インパクトが増しているだけ）

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4 years

AlphaFold 2 予測構造 30 連発。　緑: 実験により測定された正解構造　水色: AlphaFold 2 による予測構造昨夜結果が発表され、話題をさらっているタンパク質立体構造予測コンテスト #CASP14 。ダントツ１位をもぎとった DeepMind チームの予測プログラム AlphaFold 2 の革新的性能を眺めてみよう。

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@souyakuchan

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3 years

フル◯ン(２回目接種後１〜２週間経過)になってやっとしっかり免疫ができた(重症化は概ね防がれる装備を得た)ところだからそれまで決して油断しない、更には、流行っているうちはフル◯ンであっても引き続きやれる範囲の感染対策は怠らないことが大切だ。

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5 years

タンパク質折り畳みパズル Foldit で、SARS-CoV-2 の感染を防ぐ分子をデザインするコンペが始まっている。標的はウイルス粒子☀表面の突起、スパイクと呼ばれる分子だ。スパイクを介してウイルスがヒトの細胞表面に取りつくので、そこを邪魔してやれば感染成立を防げるかもしれない。

@Foldit

Foldit

5 years

Today we're calling on YOU to help design antiviral proteins against #coronavirus : The most promising solutions will be manufactured & tested at the Institute for Protein Design ( @UWproteindesign ) in Seattle. #CitizenScience #COVID #COVID2019 #citsci

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2 years

話題の #吸うやつのざっくり成分分析結果。・主成分は鶏卵由来と思われるアルブミン類やビテロゲニン・免疫グロブリン類は少量含まれる・アルパカ由来成分は検出できず卵と牛乳を混ぜて薄めたようなものに近そうだ。また、製品原液のSARS-CoV-2 RBD中和活性も測定したが、検出限界未満(ゼロ)。

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2 years

伸びたツイートから丁度１年ということでグラフの update。個人差の大きい所と考えられるが、私の場合はブースター接種後の抗体価半減期は２回目接種後よりは長かった。 #FullyVaccinated + #Boosted = #UpToDate #COVIDVaccination #GetVaccinated #Up_to_Date_with_COVIDVaccination #blockbustART

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・初回接種後しばらくはまだ免疫はついていないから気を緩めてはいけない・２回接種で抗体価は何倍にもなる(のでやはり２回打ちしたほうがいい) というのが分かるように身体を張って何十回もセルフ採血してグラフで可視化した(n=1だが)ので周りへの説明や説得に使ってくれていいぞ！ #コロナワクチン

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3 years

有効活用されている！（初耳）

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3 years

「DeepMind、ヒト+ 20 生物種のプロテオーム 35 万タンパク質ぜんぶの #AlphaFold 2 予測構造データベース公開するってよ」

@GoogleDeepMind

Google DeepMind

@GoogleDeepMind

3 years

Today with @emblebi , we're launching the #AlphaFold Protein Structure Database, which offers the most complete and accurate picture of the human proteome, doubling humanity’s accumulated knowledge of high-accuracy human protein structures - for free: 1/

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2 years

My new gear...

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3 years

ここで日本の医薬品構造式集の裏表紙を見てみよう！

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@ONODA_in_Onodac

しそごはん用研究者（薬学部講師）

@ONODA_in_Onodac

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薬学が化学に力を入れなくなったら、それ医学部の完全下位互換といっても過言ではないぞ。「体内に生じる現象」や「外的な物質に対する生体応答」について、原子・分子ベースで専門性を持ち、深く思考できるのが薬学を専門とする者の強みぞ。

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@souyakuchan

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3 years

@tIRlMEYYLndQktS せっかくなのでケースリポート的な形でどこか査読誌に出そうと思ったので微妙に数字等までは分かりにくい形にさせて頂いている🙏（いずれにしろ CLIA の arbitrary unit なのでそこまで単位に意味はない）

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@souyakuchan

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7 months

創薬の世界では毒と薬がひっくり返ることもある。

@FRIEREN_PR

『葬送のフリーレン』公式

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#フリーレン

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@souyakuchan

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2 years

乳糖 100% でしたみたいな結果が一番安全で良い。

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@souyakuchan

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2 years

作った💉 追加接種を含め、推奨されるワクチン接種が済んだ状態を Up to Date と呼ぶことになっている () 。 #iconDecotter | ブースター接種済マーク (Up to Date) | あなたのTwitterアイコンをデコレーション！ #Up_to_Date_with_COVIDvaccination

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@souyakuchan

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3 years

利用しやすいように登録しておいた！ iconDecotter | [I GOT VACCINATED ワクチン接種済マーク] | あなたのTwitterアイコンをデコレーション！アイコンデコッター version P version M #iconDecotter #FullyVaccinated

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3 years

フル◯ン者用アイコン装飾はこちら。

@souyakuchan

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3 years

利用しやすいように登録しておいた！ iconDecotter | [I GOT VACCINATED ワクチン接種済マーク] | あなたのTwitterアイコンをデコレーション！アイコンデコッター version P version M #iconDecotter #FullyVaccinated

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叢雲くすり (創薬ちゃん)

4 years

【新規 Kaggle チャレンジ】新型コロナウイルスに関連する三万本近い論文を基に、自然言語処理で知見をひねり出せ！９つのタスク: ・ウイルスの伝播、増殖、環境中での安定性について何が知られているか・COVID-19 のリスクファクターについて何が知られているか (続

@kaggle

Kaggle

4 years

We just launched a challenge focused on open #COVID19 research questions, including a dataset of thousands of relevant papers to help: Thanks @WHOSTP @allen_ai @NIH @Microsoft @Georgetown @ChanZuckerberg for the rapid collaboration on data.

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@souyakuchan

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ニホンウナギの筋肉から発見された緑色蛍光タンパク質、UnaG だ (4I3B.PDB)。脂肪酸結合タンパク質ファミリーに属し、ビリルビン (図中 yellow) を発色団として結合することで蛍光性を発揮するんだ。絶滅してしまってはこういう発見もなくなってしまう、種は守らないとな。

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@souyakuchan

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7 years

たんぱくタワーバトル

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@souyakuchan

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3 years

#COVIDVaccination #day_28 #antibody_titer コミナティ®２回目接種７日後。体調かわりなし。初回接種後デイリー採血 28 回目実施。これまでの抗体価推移: ２回目の接種により、既に初回接種後のプラトーの３倍近くに。カラダもってくれよ！！（← 特に身体に負担は無い）

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@souyakuchan

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3 years

※ フル◯ン達成済みであれば私に断りなく使って頂いて OK

@souyakuchan

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3 years

💉フル○ンなう💉 に使っていいぞ！ (アイコン用透過 PNG) ※ 各ワクチン規定の期間が経ってから装着すること #FullyVaccinated #コロナワクチン

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@souyakuchan

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1 year

Resiniferatoxin, TRPV1 ligand. 関節痛の治療薬として FDAブレークスルーセラピー指定されたとのこと。カプサイシンの天然アナログで、カプサイシンの千倍辛いらしい。辛過ぎて痛み神経が機能しなくなるという機序。投与時は激痛を催してしまうので麻酔下で関節注射される。

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レシニフェラトキシン注射剤、米でBT指定　　塩野義が国内権利持つ疼痛薬 | 日刊薬業 - 医薬品産業の総合情報サイト

　独Grunenthal社は24日までに、変形性膝関節症に伴う疼痛の治療薬として開発中のResiniferatoxin（レシニフェラトキシン）注射剤について、米FDA（食品医薬品局）からブレイクスルー…

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@souyakuchan

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3 years

ACE2 発現細胞と SARS-CoV-2 spike 発現細胞がくっついて合胞体 (syncitia; 融合して多核化した細胞) になる動画。

@eLife

eLife - the journal

3 years

The spike protein of SARS-CoV-2 interacts with cholesterol and ACE2 to induce viral entry and pathological cell-cell fusion. Can cholesterol-lowering statins be used as a treatment for COVID-19?

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@souyakuchan

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3 years

> 「免疫は2週間後に突然、できるのですか？　それとも毎日、少しずつ増えていくのですか？」 > 「少しずつです」 > それを聞いて、少し安心した。接種した翌日あるいは翌々日であっても、少しは免疫は形成されるのだから。安心してはいけない接種直後は全く出来ていないぞ

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たった4分でワクチン接種完了…トヨタが作った｢豊田市モデル｣のすごいやり方｢会場の効率運営｣だけで終わらない (2ページ目)

来場者は入り口で4色のクリアファイルを渡され、緑色の人は4階の接種会場へ、赤の人は3階へといったように割り振られる。階上へ行く場合、引率者がグループ分けした数人を引きつれて、エレベーターで上がっていく…

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

夜上げ。70 日間こつこつ毎日穿刺したので見てくれ💉（その後は３日に１回ペースの採血としている） #コロナワクチン

@souyakuchan

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3 years

続き！接種後デイリーセルフ採血 10 週間フォローアップ。 (n = 1) 初回接種後のピーク値よりは高いがブースト後のピーク値の 1/3 を少し下回ったくらいの値で横ばいへ。

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5 years

新型コロナウイルス（が有する nonstructural proteins の polyprotein を切断処理する酵素 Mpro (3CLpro); SARS ウイルスにもほぼ同様の酵素あり）に効いたとされる Lopinavir と、Lopinavir の元々の阻害対象である HIV protease との結合様式 (2Q5K.PDB)

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@souyakuchan

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6 years

血小板ちゃんとアスピリン！ #はたらくおくすり #はたらく細胞 #hataraku_saibou #勝手にコラボイラスト #souyakuchan_magic

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

1 year

#LLM 創薬チャレンジ LLM が創薬している？やれるものならやってほしい！ ……というわけで LLM をどれだけ創薬に活かせるか大会を開催する。いつも通り賞金付き。今回は参加者全員に実費として￥10k も支給する。ルール: 画像参照、詳細→ 参加登録:

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

化石の中の保存状態の悪い古代 DNA を微生物ゲノムのコンタミなどと分離して解析する難しさを乗り越えたことがブレークスルーとのこと。バイオインフォマティクス的にも高いハードルだったようだ。 #nobelprize2022 #nobelprize

@NobelPrize

The Nobel Prize

2 years

Through his pioneering research, Svante Pääbo – this year’s #NobelPrize laureate in physiology or medicine – accomplished something seemingly impossible: sequencing the genome of the Neanderthal, an extinct relative of present-day humans.

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

5 months

初耳だ。

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@nhk_news

NHKニュース

5 months

小林製薬紅麹問題「プベルル酸」健康被害の製品ロットで確認 #nhk_news

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

ご要望があったので version A を追加してみた。 iconDecotter | [I GOT VACCINATED ワクチン接種済マ��ク] | あなたのTwitterアイコンをデコレーション！アイコンデコッター version A #iconDecotter #FullyVaccinated

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

#創薬ちゃん生成チャレンジ結果発表！応募者数は実に 54 名を数え、甲乙つけ難すぎたので授賞枠を増やした。 🥇￥20000 (１件) 🥈￥10000 (２件) 🥉￥5000 (４件) 準佳作￥3000 (６件) 他、参加してくれた全員に￥500 ずつ進呈する。順次 DM にてコードを送らせて頂く。多くの御参加ありがとう！

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

#創薬ちゃん生成チャレンジ現存するAIモデルには未学習のマイナーキャラだからできるコンペを開催する。画像生成AIを使って、最も私( @souyakuchan )っぽいキャラ絵を生成した人が優勝。優勝者にギフト券１万円分、佳作２件に５千円分ずつ進呈する。応募は9/19(月)24時(JST)まで。細則: 添付画像参照

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

#創薬ちゃん生成チャレンジ現存するAIモデルには未学習のマイナーキャラだからできるコンペを開催する。画像生成AIを使って、最も私( @souyakuchan )っぽいキャラ絵を生成した人が優勝。優勝者にギフト券１万円分、佳作２件に５千円分ずつ進呈する。応募は9/19(月)24時(JST)まで。細則: 添付画像参照

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

1 year

現在またすっかりコロナが流行してしまっている。市販キットでのセルフ検査が有用だが、使う場合は精度が保証されている💊医療用 (第１類医薬品)💊のキットを入手しよう！参考) 厚生労働省: 新型コロナウイルス感染症の一般用抗原検査キット (OTC) の承認情報 #blockbustART

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@kamo_kamos

渡瀬ゆず💉

1 year

誰か「抗原検査は医療用を買おう」「薄い陽性線を見逃さないようにしよう」みたいな緩いWEBマンガ書いて拡散してくれないかなー。謝礼Amazonギフト券5000円程度 |ω・`）ちら

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

今年のノーベル生理学･医学賞をタイムリーに予言していた人がいた！ TRPV1 アゴニストであるカプサイシンは脂溶性であり、油で拭いて取り除けばデリケートなエリアの刺激が緩和されることになる。実測 log P: 3.81 (ref: ) #NobelPrize #NobelPrize2021

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Capsaicinol: Synthesis by Allylic Oxidation and Its Effect on TRPV1-Expressing Cells and Adrenaline...

Abstract. Capsaicinol is an ingredient of hot red pepper. In this study, we developed a novel method for capsaicinol synthesis and examined capsaicinol’s p

academic.oup.com

@ShIma_Megagauss

やもす

@ShIma_Megagauss

3 years

これ、マジのライフハックなんですけど、辛いもの食べ過ぎで次の日に肛門が痛い時、サラダ油をトイレットペーパーに染み込ませて拭くと痛くなくなるんですよ。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

Antibody titer follow-up for 8 months (n=1). 抗体価の経時的な低下はもはや周知の事実で特に目新しさも無いと思うが、接種後８ヶ月経過ということで久しぶりにセルフ採血データ最新版。創薬アドベントカレンダー () 記事を兼ねて: #souyakuAC2021

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

ワクチン接種後抗体価セルフモニタリング定例報告。(n = 1) ある程度サンプル数を集めた抗体価フォローアップ調査結果がここ最近いくつか報告されて来ているが、それらと概ね傾向は一致する典型的な減衰カーブ。免疫記憶によって守られ続けてはいるはずだが、引き続きできる限りの防疫を継続する。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

そんな暇人がいたのか

@gigazine

GIGAZINE(ギガジン)

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新型コロナウイルスワクチンを接種した人物が毎日採血して「ウイルス抗体価がどのように変化したのか？」を調べデータで公開

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

4 years

Folding @home で計算された SARS-CoV-2 スパイクタンパク質の長時間 MD (分子動力学シミュレーション)。ヒト細胞側の受容体である ACE2 に食いつくためかのように「デモゴルゴン(悪魔)が口を開く」と表現されている。

@drGregBowman

Greg Bowman

4 years

Great progress capturing how the ferocious #COVID19 #Demogorgon (aka spike) opens its mouth to grab its human prey. Each step could present new therapeutic opportunities. Thanks to @foldingathome @Microsoft @Azure #AIforHealth @Mizimmer90 !

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

@sknn @concert_1750 実は抗体価で分かる抗体の量だけではなく細胞性免疫や記憶細胞、抗体の特異性の成熟など、多くの要素が免疫を構成しています。また、感染自体の予防効果はさておき、重症化予防効果については、感染後に(免疫記憶のおかげで)数日で抗体が一気に産生されることもかなり効いています。(続

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

医薬品と区別して "研究用" と呼ぶ場合「(性能チェックに基づいた)国の承認を得ていない」以外の含意は本来無いのだが、粗悪品が少なくないせいで研究用 = 精度が悪いというイメージが定着しつつある。しかし粗悪品だったら "研究" にも使いものにならないので、"ジョークグッズ" 表記にしてほしい。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

突飛な説をデマと自信を持って判断するのは実は難しく、自分で論文やメーカー文書や公的審査文書などを探して批判的に読みこなせないといけない（これを怠ると医師でも研究者でも細かい部分は普通に間違える)。代替としては、普段言っていることが九割方間違えていない人や情報源を把握しておくこと。

@citrocube

輝竜司 | Tsukasa Kiryu

3 years

ぶっちゃけ、何をどれくらい勉強してたら今のワクチンやコロナの話をざっくり理解したり、リスクとベネフィットを正しく天秤にかけれたり、デマかどうかをざっくり理解や判断していけるんだろう。高校の生物でだいぶいけるとは言うけど、デマはきつそう（時々とんでもない変化球がある）

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

#COVIDVaccination #day_308 ３回目接種 day 0。(P-P-P) 接種 3 時間後にて採血実施 (通算 122 回目)。平熱。腕を上げると接種部に淡い痛みが出てきたところ。またしばらくデイリーセルフ採血を続ける。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

！ Must-buy. 実験医学別冊創薬研究のためのスクリーニング学実践テキスト～アッセイ系の選択･構築から、ヒット･リード化合物の同定、自動化まで～スクリーニング学研究会 / 編 2022 年 6 月 30 日発行

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

9 months

mRNA にシュードウリジンが入っていると翻訳時に時々フレームシフトが起きているという話、Nature。シュードウリジンのところで翻訳速度が下がることにより、リボソームが滑って塩基認識を 1 塩基分すっ飛ばすことがあるらしい。コレスポ著者のポスト。↓ Congrats!👏

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N1-methylpseudouridylation of mRNA causes +1 ribosomal frameshifting

Nature - A study demonstrates that nucleotide modifications in mRNA-based therapeutics can lead to +1 ribosomal frameshifting during translation, yielding products that can trigger immune responses.

@Thav_Lab

James Thaventhiran

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Why does an immunologist work in the MRC Toxicology unit- because I get to do really important fundamental immunology alongside the great Anne Willis.

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@souyakuchan

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1 year

ヴォート生化学の Donald Voet 先生没 (享年 84 才)。ご冥福を。

@PennChemistry

Penn Chemistry

1 year

We are deeply saddened to share the passing of Donald Voet. Don was a mainstay in our department for decades, & with Judy, his wife of 58 years, he wrote the indispensable textbook Biochemistry that has been used in countless courses for a generation.

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

6 months

大体なんでも切る酵素。

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@FRIEREN_PR

『葬送のフリーレン』公式

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【魔法紹介】 ●大体なんでも切る魔法● #フリーレン

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@souyakuchan

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2 years

AF2 によるタンパク質-ペプチド複合体の構造予測において、複数のペプチドを入力に入れるとアフィニティが強いほうが勝つというハック (preprint)。

@biorxiv_biophys

bioRxiv Biophysics

@biorxiv_biophys

2 years

AlphaFold encodes the principles to identify high affinity peptide binders #biorxiv_biophys

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

Thanks 8888 followers！👏👏👏👏

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@souyakuchan

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1 year

Good!💉

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HPVワクチン男子も全額補助

東京都中野区は子宮頸（けい）がんの原因となるヒトパピローマウイルス（HPV）への感染を予防するワクチンについて、区内に住む小学6年生～高校1年生の男子の接種費用を全額補助する取り組みを8月から始めた。区によると、男子を対象にした助成は都内自治体で初めて。HPVは性交渉などによって感染するとされ、小学6年生～高校1年生の女子は公費で接種できる。男性が感染した場合、肛門

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

4 years

COVID-19 対策のための寄付企画を私もやっておこう。本ツイートの RT 数に応じて、治療薬創出のための国際コラボプロジェクトに私の懐から寄付する。寄付先: COVID-19 Moonshot () ※ SARS-CoV-2 main protease 阻害薬デザイン公募イベント（解説: )

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

抗体価だけ見ていると、２回打ちフル◯ン後数ヶ月経って抗体価が下がった状態と１回打ち後の状態は似たようなものなのでは、という疑問に対して恐らくそうではなかろうという私見の説明の連ツイ(簡易版)。

@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

@sknn @concert_1750 実は抗体価で分かる抗体の量だけではなく細胞性免疫や記憶細胞、抗体の特異性の成熟など、多くの要素が免疫を構成しています。また、感染自体の予防効果はさておき、重症化予防効果については、感染後に(免疫記憶のおかげで)数日で抗体が一気に産生されることもかなり効いています。(続

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

Lys-Cys間架橋の発見、Nature。淋菌のトランスアルドラーゼで見つかった。酸化還元スイッチとして、Lys-Cys結合がアロステリックに酵素活性を制御。ほか既知のPDB構造内にもありそうとのこと。 A lysine–cysteine redox switch with an NOS bridge regulates enzyme function

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

実際、２回目接種後の抗体価のピーク値は初回接種後のピーク値の４倍程度になった (n = 1; 私) ので、抗体エスケープ変異による力価低下を補う意味でもやはりしっかり２回打ちすべきなのは間違いない。 #FullyVaccinated

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@MIKITO_777

知念実希人【公式】

3 years

このデータを見ても分かるように、新型コロナに対する免疫を十分得るためには2回のワクチン接種が必須です。特に免疫逃避の特徴があるE484kの変異をもつ南アフリカやブラジルの変異ウイルスには、 1回接種では20％前後しか効果がありません。皆様、2回接種をぜひ徹底して下さい。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

#10 文字ホラー #10 文字ホラー大賞

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

タグ便乗 #ド直球に言いますがフォローしてください #blockbustART 新型コロナウイルスワクチン接種後の毎日の抗体価推移を見られるのはこのアカウントだけ！（かもしれない）

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

謎の製品を分析してみようのコーナー。霧状にして吸うためのものらしい。内容液は約 430 µL で、うっすら白濁していた。スピンダウンして上清とペレットに分離でき、測ったところ上清のタンパク質濃度は約 10 mg/mL であった。ペレットはタンパク質の凝集物だろうか。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

#COVIDVaccination #antibody_titer お待ちかね、昨日(接種後 11 日目)の分までの定量 CLIA 測定結果（※ IgG と IgM の軸スケールは別個）。８〜９日目辺りで IgG は立ち上がって来ているようだ。一昨日の時点でカットオフ値は超えている。ある程度プラトーに達するまで引き続き毎日採血を続ける。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

8 months

アスピリンにペニシリンじゃないか！💊 次代を担う若者たちに創薬を志させる出題姿勢が見て取れる👏 2024 年度大学入学共通テスト化学問４:

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

製品１本分の内容液中の総タンパク質量としてもせいぜい 5 mg 程度と僅かで、概ね卵白･乳清１滴分ほどにも満たない栄養量(で定価約二千円)。かつコロナウイルスに特異的な抗体もほぼ含まれず、泳動上はスメア化しており intact な抗体があるか不明であり、これを霧状にして敢えて吸う意味は薄そうだ。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

DeepMind 公式が Colab 版を出してくれるようになったか。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

5 years

ホモロジーモデリング → ドッキング → MD とやって低分子の承認薬 1903 個の中から 2019-nCoV Mpro 酵素に阻害活性のありそうな薬剤を絞り込んだ報告。ドッキングは正直、当たるも八卦当たらぬも八卦なところもあるが、お手本的な手順を踏んでいて勉強になるのでちょっと見てみよう。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

抗体価の減衰に合わせてアイコンの枠のアルファ値を変えてみた。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

COVID-19 死者 85 名から内視鏡的に嗅上皮と嗅球を採取し感染組織を調査 (Cell)。感染していたのは嗅上皮の支持細胞 (sustentacular cells) で、ニューロン自体はやられていなかったらしい。嗅上皮は再生しうるので、いずれ治る見込みが比較的あるということか？

@EricTopol

Eric Topol

3 years

Stunning visualization of #SARSCoV2 infecting the olfactory (smell) and respiratory mucosa (cell lining), but not the neurons (reassuring!) in 85 people who died from Covid soon after their infections @CellCellPress

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

10 months

RoseTTAFold All-atom に続き AlphaFold にも全部載せ版が来た。 AlphaFold-latest、タンパク質-核酸/抗体/リガンド/修飾などを含めた構造予測に幅広く対応とのこと。 Blog: 詳報:

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A glimpse of the next generation of AlphaFold

Progress update: Our latest AlphaFold model shows significantly improved accuracy and expands coverage beyond proteins to other biological molecules, including ligands.

deepmind.google

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

Thanks！私がしないように心掛けていること: ・「予言」めいたことは大きな声で言わない（予言を当てて自己満足しても懐は潤わないので先読みは株の銘柄選定等のためにやる）・義憤の棒で叩き屋をしない、不毛なレスバをしない・新規科学知見をむやみにセンセーショナルな言い回しで紹介しない

@rrrelll

あるる

3 years

創薬ちゃん、科学技術インタープリターとして理想的な活動してる

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

@concert_1750 （ここだけの話なんですが、先生、ヅラ取れてますよ）（小声）

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

1 year

ゴム工場の労働者が下戸になる → ゴムの硫黄加硫 (硫黄系の架橋剤の添加による硬度や弾性の調整) に携わっていた → アルコール依存症治療薬として応用 → ジスルフィラム (ALDH 阻害剤)

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@rootport

Rootport🔥

1 year

「くそっ、この薬は失敗だ！狭心症の特効薬になると思ったのに…」「残念です…」「それじゃ、治験で配った薬を回収しようか」「それがですね」「？」「なぜかみんな返そうとしないんですよ。とくに男性が」「男性が？ふーむ、妙だな…？」っていうバイアグラの開発史めっちゃ好き。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

7 months

めちゃくちゃユビキチン化「される」低分子の報告 (preprint)。ユビキチンを奪いまくるので細胞内のタンパク質分解系が止まるレベルとのこと。やりようによっては TPD に使えるだろうか？リシンが露出していない標的など。

@JonathanOstrem

Jonathan Ostrem

@JonathanOstrem

7 months

Excited to share our new preprint describing intracellular ubiquitination of a small molecule, BRD1732, a molecule that has remained a mystery since identification in early 2010s by Enrique Garcia-Rivera, @micahmaetani , @SchreiberStuart and @CKadoch . 🧵

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

2 years

原液の性状として、うっすら白濁していたのは乳清由来、微かに粘性があったのは卵白由来のものだったのかもしれない。製品パッケージ上の注意書きにも記載されてはいるが、卵･牛乳アレルギーのある人は決して使わないよう注意。 (つづく(かも))

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

8 months

バッドサイエンスを見分ける術 12 箇条。 1. 煽った見出し 2. 結果の誤解 3. 利益相反 4. 相関と因果の混同 5. 言い過ぎな結論 6. 小さいサンプルサイズ 7. 偏ったサンプル 8. 対照群なし 9. 盲検化なし 10. チェリーピック 11. 再現性なし 12. 査読なし非トンデモ側にいるつもりでも気を付けよう。

@compoundchem

Compound Interest | Chemistry infographics

8 months

For the 10th anniversary of Compound Interest, I'm counting down the most popular graphics I've made over the past decade. Coming in at #10 is a graphic on things to look out for when reading scientific articles or studies, particularly when they make health or medical claims.

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

今月末までには Pfizer がオミクロン用ワクチンのヒトでの試験を開始。現行ワクチンも効いてはいるし実際に使うかどうかは状況に応じたニーズ次第としつつも３月末頃までに出荷の準備自体はできるとのこと。

@AndrewE_Dunn

Andrew Dunn

3 years

Exclusive: Pfizer plans to start human studies of its Omicron-specific COVID-19 vaccine in late January, the drugmaker's top scientist tells me:

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

あけましておめでとう！毎年元旦恒例、創薬おみくじ。タップ/クリックで今年の創薬運を占うぞ。引いたらスクリーンショットでつぶやいてみよう！今年は 36 種類🌄 #創薬おみくじ #dd_fortune_2022 #叢薬大社 #souyakuchan

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

#COVIDVaccination #day_0 接種したところの三角筋に軽度の圧痛および上腕挙上時に疼痛あり。楽にしていれば特に違和感なし。

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

細胞治療および遺伝子治療 (Cell and gene therapies; CGTs) がⅢ相以降でポシャった理由の内訳の集計。薬効不足に次いで、CMC (化学･製造･品質管理) の問題でコケているらしい。

@NatRevDrugDisc

Nature Reviews Drug Discovery

@NatRevDrugDisc

3 years

Disruptions in the development of cell and gene therapies This new analysis indicates that 43% of cell and gene therapies had a disruption during development in 2016-2021, with CMC issues being a key cause that is more common than for monoclonal antibodies

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@souyakuchan

叢雲くすり (創薬ちゃん)

3 years

#COVIDVaccination #day_1 接種１��後。打った側の肩関節を外転方向に少し上腕挙上すると接種部位（三角筋）が痛む（肩関節屈曲方向の挙上はあまり痛まない）。圧痛あり。発赤、腫脹、熱感は無し。ほか特記症状なし。抗体価測定用にセルフ採血。後日何本かまとめて測る。

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