د.إبراهيم المازني Profile Banner
د.إبراهيم المازني Profile
د.إبراهيم المازني

@ibrahimalmazni

2,675
Followers
1,187
Following
317
Media
12,955
Statuses

Assistant Professor @Najran_Univers , MSc in Molecular Genetics @uniofleicester , PhD in Molecular Genetics @unibirmingham .

Abha, Kingdom of Saudi Arabia
Joined March 2012
Don't wanna be here? Send us removal request.
Pinned Tweet
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
الحمدلله الذي ما خُتم جهدٌ ولا تمّ سعيٌ إلا بفضله وتوفيقه🌹. ورقتنا البحثية التي تم قبولها ونشرها مؤخرا بإحدى مجلات نيتشر.
@NatureCVR
Nature Cardiovascular Research
1 year
Barrachina et al. present a #lipidomic analysis of different stages of #thrombopoiesis and demostrate that #FattyAcid uptake through CD36 is essential for #megakaryocyte maturation and #platelet production| @nubama @theclotthickens |
2
15
63
10
2
44
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
أنواع الانماط الوراثية: ١- Autosomal بحيث ان الجين المسؤول عن السمة الوراثية موجود على احد الكروموسومات الجسمية autosomal chromosomes وهي الكروموسوم من ١ الى ٢٢ ٢- sex-linked بحيث ان الجين المسؤول عن السمة الوراثية موجود على الكروموسوم X او Y وهو كروموسوم ٢٣
2
25
228
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
استخدام قاعدة NCBI للحصول على بعض المعلومات لجين معين مثل : ١- تسلسل الجين ٢- تسلسل البروتين ٣- تسلسل mRNA ��- mRNA transcripts ٥- التعبير الجيني للجين في الخلايا ٦- تصميم برايمر ٧- variation& pathways ,,,,
11
54
217
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
اساسيات تفاعل PCR: *عدد الدورات 30-35 دورة وكل دورة تتضمن التالي: ١- denaturation وهي عملية فصل شريط DNA وتكون على درجة حرارة 95 مئوية لمدة 30 ثانية ٢- annealing وهي عملية ارتباط primer بالمنطقة المراد عمل تسلسل لها وتكون عادة على درجة حرارة 55-60 درجة مئوية لمدة 30 ثانية
Tweet media one
3
37
226
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 months
لمعرفة تطابق التسلسل لجين او بروتين معين، هناك نوعين من sequence alignment: 1- pairwise sequence alignment: هنا نقدر نعمل تطابق لتسلسلين في وقت واحد سواء جين او بروتين 2- multiple sequence alignments: نقدر نعمل تطابق لاكثر من تسلسل في نفس الوقت
Tweet media one
0
31
197
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
🧬من يرغب في تقديمي لدورة عن 🧬 Pathogenicity prediction واستخدام بعض bioinformatics tools للتنبوء عن تأثير الطفرات او المتغيرات على البروتين. ✨انتظر ردودكم✨
42
17
182
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Alleles & zygosity: Allele: عبارة عن نسخة من جين معين حيث ان الانسان يعتبر diploid لانه يحتوي على نسختين من نفس الجين( نسخة من الاب ونسخة من الام).
Tweet media one
3
23
163
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
💡Epigenetics يسمى علم مافوق الجينات وهو العلم الذي يهتم بدراسة التغيرات الوراثية في التعبير الجيني للجينات عن طريق تنشيط او تثبيط الجينات دون حدوث تغير في تسلسل الحمض النووي الأساسي.
Tweet media one
2
30
153
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Mosaicism: مصطلح وراثي يعرف (الفسيفساء الجينية او الموزاييك) وهو عبارة عن وجود تركيبتين وراثية او اكثر مختلفة في نفس خلايا الشخص والتي نتجت من نفس اللاقحة zygote.
Tweet media one
5
37
156
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
الحمدلله من قبل ومن بعد بفضل من الله وتوفيقه ثم بفضل دعاء الوالدين أجتزت اليوم مناقشة رسالة الدكتوراه في تخصص الوراثه الجزيئية من جامعة برمنجهام. شكرا لجميع افراد عائلتي وزوجتي واصدقائي ووطني على دعمهم لي خلال هذه الرحله. اللهم لك الحمد والشكر كما ينبغي لجلال وجهك وعظيم سلطانك
Tweet media one
90
20
146
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
بعض المصطلحات في علم الوراثة🧬 1- Amorph ( null allele) هو الاليل او نسخة من الجين تؤدي إلى فقدان كامل لوظيفة الجين 2- Artifact sequencing هي المتغيرات التي تحدث في تسلسل DNA نتيجة عمليات غير بيولوجية بسبب التفاعلات الكيميائية في تقنية التسلسل الجيني والتي قد تحدث أخطاء
2
25
148
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
كيف تصمم برايمر primer ؟ ادخل على موقع UCSC genome browser 👇 ثم اتبع الخطوات كما هي موضحه في الصور التاليه:
Tweet media one
6
30
129
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
💡 أنواع الجينات التي يمكن أن يؤدي حدوث خلل بها إلى الإصابة بالسرطان : ١- الجينات كابتات الأورام Tumour suppressor genes 2- الجينات المحفزة للورم او الأنكوجينات Oncogenes 3- الجينات المسؤولة عن إصلاح أخطاء الحمض النووي DNA repair genes 4- التيلوميريز Telomerase 5- الجين p53
2
24
132
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
خطوات ومبدأ عمل Next Generation Sequencing NGS 👇 ١- تحضير العينة او مايسمى المكتبه ( Library ) ٢- التسلسل (Sequencing) ٣- تحليل البيانات ( Data analysis)
Tweet media one
4
31
127
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
DNA Microarray ( DNA Chip): تستخدم هذه التقنيه لقياس مستوى التعبير الجيني لجين معين او مجموعة جينات حيث تعتمد على وجود مجموعة من DNA spots مرتبطة وملتصقه على nanowells في شريحه صغيره.
Tweet media one
6
33
119
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
🧬Genetic variations او مايعرف بالمتغيرات الجينية قد تحدث في الحمض النووي على مستوى النيوكليوتيدات، اختلافات في عدد نسخ أجزاء معينة من الحمض النووي، أو حتى على مستوى الكروموسوم 🧬 DNA Variations ينقسم إلى: A- Nucleotide level B- Chromosomal level 👇يتبع
2
32
119
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
ما الفرق بين mutation و polymorphism؟ يمكن تعريف mutation على انها تغير في تسلسل النيوكليوتيدات والتي قد تسبب او تؤدي إلى مرض معين. يمكن تعريف polymorphism على انه تغير في تسلسل النيوكليوتيدات ولكن لايسبب اي مرض ويمكن ان يوجد ب frequency ٪١ او اعلى بين سكان مجتمع معين.
Tweet media one
2
25
114
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
وش معنى codominance في علم الوراثة؟ عبارة عن نوع من الوراثة يتم فيه التعبير عن نسختين من الاليلات alleles من نفس الجين بشكل منفصل لانتاج سمات وصفات وراثية مختلفة في الفرد. بدلا من ان تكون احدى الصفات سائدة على الاخرى، تظهر كل الصفتين في الفرد.
Tweet media one
6
13
108
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Pluripotent cell خلية "رئيسية" لديها القدرة على إنتاج جميع أنواع الخلايا الأخرى التي يتكون منها الجسم ولها القدرة على الانقسام والتجديد من نفسها
Tweet media one
2
23
85
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
تسلسل الحمض النووي DNA sequencing هو عملية قراءة وتحديد تسلسل النيوكليوتيدات في قطعة معينة من شريط DNA. ومن التقنيات المستخدمة في ذالك Sanger sequencing حيث اكتشفت عن طريق عالم الكيمياء الحيويه البريطاني Frederick Sanger عام ١٩٧٧ والذي حصل على جائزة نوبل في الكيمياء.
Tweet media one
2
28
83
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
ماهو codominance في الصفات الوراثية؟ التوريث السائد المشترك هو نوع من التوريث حيث يتم التعبير عن نسختين (أليلين) من نفس الجين بشكل منفصل ليؤدي ذلك إلى ظهور صفات مختلفة في فرد واحد. وبدلاً من أن تكون صفة واحدة مسيطرة على الأخرى، تظهر كلتا الصفتين. مثل فصيلة الدم AB
Tweet media one
1
23
82
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
انواع واشكال الجينات التي تعبر عن الصفات الوراثية: Monogenic trait: عبارة عن جين واحد يعبر عن الصفة الوراثية Polygenic trait: عبارة عن اكثر من جين تعبر الصفة الوراثية Multifactorial or complex trait: عبارة عن اكثر من جين يعبر عن الصفة الوراثية وقد يدخل فيها بعض العوامل البئية
1
10
77
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Exome Variant Server (EVS) عبارة عن قاعدة بيانات للمتغيرات الجينية genetic variants بعد عمل exome sequencing لمجموعة كبيرة من الأفراد من أسلاف مختلفة. تساعد هذه القاعدة في البحث والكشف عن novel genes المتعلقة ببعض الامراض والتي قد لاتوجد في هذة القاعدة. طريقة استخدامه👇
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
Tweet media four
2
18
75
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Microsatellite or short tandem repeat(STR): عبارة عن اجزاء وقطع من الحمض النووي تتألف عادة من واحد الى ستة ازواج من القواعد النيتروجينية او اكثر من ذالك، والتي تأتي بشكل متكرر عدة مرات في مناطق معينة من الجينوم.
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
2
16
74
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 months
ثريد مبسط عن بعض المعلومات الموجودة في قاعدة بيانات Nucleotide في NCBI والتي تعطي معلومات واسعة ومفصلة عن كل جين👇
Tweet media one
1
22
73
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
Copy number variation (CNV) عبارة عن نوع من انواع التغيرات التركيبيه الجينيه حيث تؤدي الى تغير عدد النسخ لجين معين او منطقه معينه في الجينوم سواء بالحذف deletion او الاضافه duplication.
Tweet media one
3
12
70
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
خبر جميل لله الحمد والمنه بقبول إحدى ابحاثي في مرحلة الدكتوراه في مجلة Nature Cardiovascular Research اللهم له الحمد وله الشكر دائما وابدا
Tweet media one
28
9
68
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
Transformation عبارة عن عمليه او تقنيه يمكن من خلالها ادخال الحمض النووي foreign DNA الى داخل خليه بكتيريه عن طريق الجدار الخلوي لها بحيث يمكن لهذه الخليه التعبير عن هذا الجين داخلها.
Tweet media one
1
11
57
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
7 months
ماهو بروتينات الهيستونات Histones هي مجموعة من البروتينات التي تلعب دورا مهما في تغليف الحمض النووي DNA داخل الخلايا لتشكل ما يسمى الكروماتين، حيث لها دور كبير في تنظيم عملية التعبير الجيني للجينات عن طريق بعض التعديلات الكيميائية مثل acetylation, methylation and phosphorylation
Tweet media one
0
23
61
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
كيف تتم عملية RNA splicing؟ هذه العمليه تتم داخل النواه بعد نسخ DNA الى RNA. في حالةً pre-mRNA، تكون الانترونات والاكسونات موجودة مع بعض ويتم التخلص من الانترونات عن طريق عملية RNA splicing. تحتوي الانترونات على تسلسلين مهمة في عملية فصل الانترونات عن الاكسونات ،،،يتبع👇
3
12
57
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
RNAi ( RNA interference) من العمليات المهمه والمستخدمه في العديد من الكائنات الحيه لتنظيم عملية التعبير الجيني gene expression. بالامكان استخدام هذه التقنيه لعمل تثبيط للتعبير الجيني gene expression لبروتين معين عن طريق عمل gene silencing or knockdown.
Tweet media one
2
16
54
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 months
انواع قواعد البيانات البيولوجية biological databases 1- Primary databases: وهي التي تحتوي على بيانات مصدرها الاساسي من التجارب مثل: -بيانات التسلسل الجيني sequencing data -بيانات التعبير الجيني مثل microarray امثلة عليها: NCBI database GEO database PDB database ZINC database
1
10
52
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
@samarasiri Follow this guide 👇🏻
0
5
53
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
7 months
ماهو Human reference genome عبارة عن مرجع لتسلسل الجينوم البشري حيث يتم استخدامه للمقارنة مع تسلسل اي عينة يعمل sequencing للكشف عن الطفرات والمتغيرات الجينية في العينه. هذا المرجع يعمل له تحديثات كل فترة لتواكب المتغيرات الجينية التي تم تحديدها مسبقا.
Tweet media one
3
24
53
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
7 months
Nonesense mutation او مايسمى stop gain mutation عبارة عن طفرة وراثية تؤدي إلى إنتاج بروتين ناقص فيه تسلسل الأحماض الامينية وبالتالي إنتاج بروتين غير مكتمل مما قد يؤدي الى فقد بعض اجزاء البروتين الوظيفية المهمة.
Tweet media one
2
13
49
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
ماهو الفرق بين Thymine في DNA و Uracil في RNA؟ Uracil في RNA يفتقد الميثيل قروب CH3 على ذرة الكربون رقم 5 عكس thymine الذي يحتوي على CH3
Tweet media one
1
12
49
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
7 months
ماهو Gene panel sequencing هي مجموعة من الجينات التي لها ارتباطات معروفة او مشتبه بها بمرض معين او متلازمة او ظاهرة جسدية حيث يتم استخدامها كثيرا في العيادات الوراثية للتشخيص. يوجد العديد من قواعد البيانات التي تحتوي على هذة الجينات مثل PanelApp
1
13
47
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
Organoid? "العضو النمطي هو تركيب ثلاثي الأبعاد يتم زراعته من الخلايا الجذعية ويتم تصميمه لمحاكاة تركيب ووظيفة عضو محدد أو نسيج في الجسم. يتم تطوير العضو النمطي بزراعة الخلايا الجذعية في وسط زراعي مناسب، حيث يتم تحفيزها بالمواد الحيوية اللازمة لنمو الخلايا في هذه الاوساط الزراعيه
Tweet media one
Tweet media two
2
11
47
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Copy number variants (CNVs) are regions of our genome that vary in copy and number, either due to duplication or deletion. تغير عدد النسخ لمناطق معينة في الجينوم البشري اما بالحذف او المضاعفة والتي قد تحتوي على بعض الجينات، ونتيجة لذالك تتغير عدد نسخ هذه الجينات.
Tweet media one
1
12
46
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
PolyPhen-2 عبارة عن برنامج يمكنك عن طريقه معرفة مدى تأثير تغير حمض أميني في تسلسل بروتين معين على وظيفة وتركيب ذالك البروتين
Tweet media one
1
13
42
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
في السنوات الأخيرة كان هناك العديد من التطورات الجديدة في تقنيات تسلسل الحمض النووي (DNA) التي قدمت تحسينا في سرعة ودقة وكفاءة وقلة تكلفة تسلسل الحمض النووي وفيما يلي بعض الأمثلة:
Tweet media one
2
7
45
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
اللهم لك الحمد ولك الشكر دائمآ وابدا تم نشر ورقتنا العلمية بمجلة Nature Cardiovascular Research
Tweet media one
6
5
44
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
What is allele? هو عبارة عن احد اشكال وانماط الجين الذي الذي يقع في مكان معين في احد الكروموسومات والذي يورث من الآباء للأبناء. معظم الجينات تحتوي على two alleles حيث يورث احدهما من الأب parental allele والأخر من الأم maternal allele
Tweet media one
4
21
39
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
11 months
💡تنقسم الخلايا الجسدية somatic cells بشكل منظم حيث تحتوي على نسختين من كل الكروموسوم diploid. ولكن قد تتعرض هذه الخلايا الى حالة تضاعف كامل الجينوم تسمى whole genome doubling حيث تنتج هذه الخلايا اربع نسخ من كل كروموسوم tetraploid
1
9
38
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 months
للمهتمين في مجال single cell sequencing راح يكون فيه بكرة محاضرة بعنوان Unlocking Cellular Insights: The Power of Single-Cell Sequencing & Spatial Transcriptomics للتسجيل👇 رابط الحضور👇
1
16
37
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Frameshift variant: متغير جيني يغير طريقة قراءة الكودونات أثناء عملية تكوين تسلسل الأحماض الأمينية ويحدث بسبب اكتساب gain او فقد lost نيوكليوتيدات وبالتالي تؤثر على تسلسل الأحماض الامينية
Tweet media one
0
5
36
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA): عبارة عن تقنيه تم تطويرها ولها القدره على الكشف وتحديد عدد النسخ لجين معين. يمكن ان تستخدم هذه التقنيه للكشف والتشخيص عن بعض الامراض الوراثيه التي تنشأ بسبب وجود CNVs في جينات معينه.
Tweet media one
3
8
35
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
بعض الصور اللي التقطتها اليوم لجمال جو الربيع اليوم🌹💔
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
3
5
33
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
يوجد انواع كثيرة من RNA Genes والتي لها أدوار وظيفية مختلفه، بعضها يكون individual RNA وبعضها يكون RNA families وتتضمن التالي حسب الدور الوظيفي: 1- Protein synthesis and export: -mRNA -rRNA -tRNA -7SL RNA ويكون مسؤول عن تنظيم عملية تصدير البروتين من الخلايا
Tweet media one
5
9
33
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
احدث تقنيات Microarrays من شركة Illumina والتي تحتوي على اكثر من 1.5 مليون من markers للجينوم البشري والتي تساعد الباحثين والاطباء في دراسة وتحليل الجينوم البشري بدقة وسرعة اكبر
1
9
30
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
Pairwise sequence alignment ينقسم الى نوعين: 1- Global pairwise sequence alignment 2- Local pairwise sequence alignment
Tweet media one
2
10
31
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
11 months
@samarasiri بعض Bioinformatic tools اللي ممكن تساعد في pathogenicity prediction: Mutation Taster PolyPhen PROVEAN CADD PhastCons هذي المواقع تعطيك تصور عن تاثير الطفرة على تركيب ووظيفة البروتين
1
6
30
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
سعدت بالحضور والمشاركة بورقة علمية في المؤتمر العالمي للجينوم والجينات والذي يعقد كل خمس سنوات مره واحدة وبحضور اكثر من ١٣٠٠ مشارك من اكثر من ٥٠ دولة على مستوى العالم.
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
Tweet media four
7
2
29
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
7 months
جودة البيانات للتسلسل الجيني بعد عمل Sanger sequencing جدا مهمة للحصول على نتيجة موثوقة 👇ولكن هناك بعض الاخطاء قد تحصل وبالتالي تؤثر على النتيجة وجودة البيانات
Tweet media one
4
10
30
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
تعرف نظرية التطور Evolution theory بأنها تغيرات في الصفات الوراثيه المتوارثة بين الكائنات الحيه مع مرور الزمن، والتي تؤدي إلى إنتاج أنواع متعددة أو إحداث تغيرات في التسلسل الجيني للكائن الحي وبالتالي إنتقالها إلى الأجيال المتعاقبه وهذا عادة ينتج من خلال إحدى الطرق التاليه:👇
1
3
28
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
11 months
SNPs&GO عبارة عن pathogenicity prediction tool أداة تستخدم gene ontology لمعرفة مدى تأثير الطفرة الوراثيه على تسلسل وتركيب ووظيفة البروتين👇 رابط الموقع
Tweet media one
1
8
26
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
بروموتر ( promotor) عبارة عن تسلسل قصير ومميز يقع في upstream region قبل نقطة بداية الاستنساخ ويكون ضروري لبدء عملية الاستنساخ من DNA الى RNA. وقد تؤدي بعض الطفرات الوراثيه في هذه المنطقه الى خلل او فشل عملية الاستنساخ.
Tweet media one
1
3
26
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
الحمد لله والشكر
@CVS_UoB
Cardiovascular Sciences (CVS)- UoB
5 years
Read all about it: @rachel_stapley @neilvmorgan @ibrahimalmazni have been published in @FrontiersIn . Read how they explain how genes and genetic variants may have association with bleeding in inherited thrombocytopenia cases. Please read more
Tweet media one
0
1
12
16
2
25
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
Gain of function mutations أو ماتسمى بطفرات كسب الوظيفه وهي عبارة عن طفرات وراثية تؤدي إلى تغير منتجات الجين gene products بحيث تؤدي إلى : 📍إحداث وظيفة جديدة للبروتين والتي يمكن أن يرى أثرها على مستوى النمط الظاهري phenotypic level. 📍 زيادة نشاط وكمية البروتين عن الطبيعي
Tweet media one
1
5
23
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
بعض البرامج المستخدمة لتحليل وقراءة ملف الكروماتوجرام بعد عمل Sanger sequencing: 1- 4Peaks 2- snapGene Viewer 3- FinchTV 4- Chromas
3
5
24
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
برنامج تدريب صيفي في جامعة الملك عبدالله للعلوم والتقنية ( كاوست) لمدة ٨ أسابيع. فرصة للالتحاق بهذا البرنامج المميز
Tweet media one
0
4
17
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
DECIPHER هي قاعدة بيانات تستخدم عادة من قبل الأطباء والباحثين لمشاركة ومقارنة جميع البيانات الجينومية genetic data ومقارنتها بالصفات والبيانات الظاهرية phenotypic data
1
1
19
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
📍Strategies for Exome-based disease- gene identification: Sequencing a patient’s exome will typically reveal around 20,000 variants relative to the Reference Human Sequence.
Tweet media one
1
8
18
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
تم بحمد الله اليوم قبول ورقتنا البحثيه بعنوان: A novel RUNX1 exon 3 - 7 deletion causing a familial platelet disorder Thanks for all the collaborators 👇
@neilvmorgan
Prof Neil Morgan 💙
4 years
NEW PUBLICATION..A novel RUNX1 exon 3 - 7 deletion causing a familial platelet disorder @ibrahimalmazni ,Pavel Chudakou,Alison Dawson-Meadows @Kate_Sci @KathleenFreson Joanne Mason Paula Page @Kimslowther @BethanMyers @bhamplateletgrp @ICVS_UoB @TheBHF
Tweet media one
0
3
22
3
3
19
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
قد يؤثر سلوك الشخص والعوامل البيئية على التعبير الجيني للجينات دون تغير في تسلسل الجين وذالك عن طريق تنشيط turn on وتثبيط turn off الجين من خلال البروتينات المرتبطة بالتعبير الجيني وذالك من خلال عدة طرق: 1- DNA Methylation 2- Histone modification 3- Non-coding RNA
Tweet media one
1
2
18
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
شرح مبسط عن عملية فصل الإنترونات عن الإكسونات اوما يسمى ب(mRNA splicing )خلال عملية صنع البروتين. mRNA Splicing via @YouTube
0
3
17
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Flow chart of common Next generation sequencing approaches(NGS)👇 Ref:
Tweet media one
0
4
15
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
ادخل على الموقع من خلال الرابط ١- اختر Gene واكتب اسم الجين والنوع ٢- search ٣- اضغط على الجين
Tweet media one
1
4
15
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
Tweet media four
1
2
15
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
تم البدء في استخدام برنامج Sapientia من #Congenica والذي يستخدم لتحليل تسلسل الإكسوم الكامل او مايعرف ب (whole exome sequencing) للكشف عن الطفرات الجينيه المسببه للأمراض الوارثيه. @Dr_FUADMUTAIRI @naifalmontashir @adeelchaudhary @KACST @KFSHRC @Congenica
Tweet media one
0
3
13
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
٣- mitochondrial تكون السمة موجودة في DNA اللي في الميتوكوندريا ويتم توريثه عن طريق الام
1
2
14
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
وش معنى candidate gene يشير مصطلح الجين المرشح إلى جين يعتقد أنه مرتبط بصفة معينة، مثل مرض معين أو صفة جسدية. ونظرًا لموقعه الجينومي أو وظيفته المعروفة، يشتبه في أن الجين يلعب دورًا في تلك الصفة، مما يجعله مرشحًا للدراسة الإضافية.
0
3
14
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Aneuploidy: The presence of an abnormal number of chromosomes in a cell, which can be more or fewer than the normal number. تغير عدد الكروموسومات في الخلية البشرية عن العدد الطبيعي ( ٤٦ كروموسوم ) حيث يمكن أن يكون أكثر أو أقل من العدد الطبيعي.
2
7
13
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
احيانا نواجه مشكلة في citation في endnote حيث يظهر لنا عند اضافة مرجع داخل الوررد علامة hash# كما في الصورة. لحل هذه المشكلة نتبع الخطوات التاليه 👇
Tweet media one
1
1
13
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
لمعرفة التماثل والتشابه Homology لتسلسل جين معين، بروتين، متغير ما ومقارنته بأنواع أخرى من الكائنات الحيه يمكنك اتباع الخطوات التاليه👇 ادخل على موقع NCBI ١- ادخل اسم الجين ٢- search ٣- اختار الجين
Tweet media one
1
4
13
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
University of Birmingham during the Christmas break 2020 @unibirmingham
Tweet media one
Tweet media two
Tweet media three
1
1
12
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
Transcription factors عوامل النسخ عبارة عن بروتينات ترتبط بمنطقة معينه من الجين حول المحسن promoter حيث تساعد وتنظم عملية التعبير الجيني اما بالتفعيل turn on او التثبيط turn off.
Tweet media one
2
4
11
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
بعض الأحيان نلاحظ وجود صفتين او أكثر موجوده ومنتشره مع بعض كثيرا بين أفراد العائلة مثل لون الشعر والعيون. هذا بسبب وجود الجينات المسؤولة عن هذه الصفات بالقرب من بعض على نفس الكروموسوم وتسمى linked genes.
Tweet media one
1
4
12
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
DNA damage can arise as a result of: 1- environmental mutagens such UV irradiation( sunlight), X-rays, carcinogens in food 2- damage to DNA from intrinsic cellular metabolism e.g. generation of free radicals and ROS 3- errors in DNA replication 4- spontaneous disintegration
0
2
12
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
فيديو جميل يشرح كيفية عمل passaging cells Passaging Cells: Cell Culture Basics Source: Thermo Fisher Scientific
0
2
12
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
SIFT and PolyPhen2 are two valuable programs that predict whether an amino acid substitution affects protein function so that users can prioritize substitutions for further study. يمكن استخدام هذين التطبيقين لمعرفة مدى تأثير تغير حمض أميني معين على وظيفة البروتين.
Tweet media one
0
4
12
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
لا تلوموني في هواها .. قبل ما تشوفوا بهاها هي بس اللي هويتها .. قلبي ما يعشق سواها قلبي حبك والله يا ابها انتي اجمل من الخيال .. شفت نورها عند بابها قلبي حن للجمال .. قلت ادخل اشوف جمالها .. اشوف بهاها اشوف دلالها .. لا تلوموني في هواها قلبي ما يعشق سواها
Tweet media one
4
2
11
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 months
3- Copy number variants: وهذه تغيرات جينية تتضمن تكرار أو حذف أجزاء أو مناطق معينة من تسلسل DNA وعادة تكون 50 قاعدة أو أكثر مما يؤدي إلى تغيرات في عدد نسخ أجزاء معينة من الجينوم 🧬 Amplification ( Gain) 🧬 Deletion ( loss)
Tweet media one
Tweet media two
1
5
11
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 years
ELISA شرح الاليزا بالعربي
0
0
11
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Tweet media one
0
1
11
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
1 year
What is Faternal twins? "التوائم غير المتطابقة (المعروفة أيضًا باسم التوائم ثنائية المنشأ) تنتج من تخصيب بويضتين مختلفتين بواسطة حيوانات منوية مختلفة خلال نفس الحمل. قد لا يكون للتوائم غير المتطابقة نفس الجنس أو المظهر ولكن قد يشتركون بنصف من جينومهم، تمامًا كأي أشقاء آخرين.
Tweet media one
1
1
10
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
De novo mutation? هي تغير جيني (طفره) تظهر لأول مره في أحد أفراد الأسره نتيجة حدوث طفره وراثيه في germ cell ( egg or sperm) لأحد الوالدين او نشؤء هذه الطفره في البويضه المخصبه خلال مرحلة التطور الجنيني مما يؤدي الى انتقالها لأحد المواليد وقد تتوارث مستقبلا في العائله.
Tweet media one
0
3
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
التوكل على الله الخطوه الأولى إلى النجاح. لا تستسلم مهما واجهت في حياتك من صعوبات وعقبات، كلها زائله بإذن الله بالتوكل على الله أولًا ثم بقوة وعزم إرادتك. Never give up
Tweet media one
0
42
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 years
What is an operon?
Tweet media one
Tweet media two
0
3
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
5 months
التقنيات المستخدمة في قاعدة بيانات البروتين PDB لعمل 3D structure للبروتين هي: 1- X-ray Crystallography 2- Nuclear Magnetic Resonance ( NMR) 3- Cryo-Electron Microscopy ( Cryo-EM)
0
2
10
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
اذا كانت في الخلايا الجسدية somatic يطلق عليها اسم somatic mosaicism اذا كانت في الخلايا التناسلية germinal تسمى gonadal mosaicism اذا كانت مزيج بين somatic & germinal تسمى gonosomal mosaicism
2
2
10
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
3 years
اللهم لك الحمد حتى ترضى 🤲🏼 شرف عظيم و فرحة كبيرة أن يتم تكريمي بضمي إلى لوحة الشرف في الملحقية الثقافية بالمملكة المتحدة🇸🇦
6
0
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
6 years
A nonsense mutation is a genetic mutation in a sequence of DNA that results in a premature stop codon in the transcribed mRNA and subsequently in a truncated ( incomplete) and usually nonfunctional protein product.
Tweet media one
0
6
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
2 years
Homozygous: اذا كان يحتوي على نسختين من نفس النسخة allele مثل ( AA or aa) Heterozygous: اذا كان يحتوي على نسختين مختلفة مثل (Aa or Bb) Hemizygous: اذا كان يحتوي على نسخة واحدة فقط
1
0
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
4 months
دراسة للبحث عن الظواهر المميته lethal phenotypes والتي تم فيها استخدام المصطلحات من قاعدة البيانات OMIM وتم تصنيف الجينات المرتبطة بهذه الامراض وفقا لاقرب عمر للوفاة، مرحلة الوفاة قبل الولادة.
1
1
9
@ibrahimalmazni
د.إبراهيم المازني
11 months
كي توصل إلى هدفك.. ثق بالله ثم بنفسك، وثبت خطاك، واترك الخوف جانبا
0
1
9