Hironori Funabiki @HironoriFunabi1 Twitter profile

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Hironori Funabiki

2 months

Excited to share the revised version with a new title "CDCA7 is an evolutionarily conserved hemimethylated DNA sensor in eukaryotes" now published @ScienceAdvances ! Congrats @IsabelWassing , @QingyuanJia , @NishiyamaAtsuya , @KyoheiArita !

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

10 months

New preprint from the lab led my talented postdoc @IsabelWassing ! She discovered that CDCA7's unique zf-4CXXC_R1 domain acts as a novel hemi-methylated DNA binding module to recruit the nucleosome remodeler HELLS and help DNA methylation! Check out her tutorial!

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

しかし、ニューヨークに住んでいる身からすると、日本の新型コロナウイルスの対策は、ここまで凄くうまくやってきたと思うのだけれど、どうしてここまで怨嗟の声が渦巻いているのだろう？日本的といえばそれまでだけど、百点満点の正解は何なの？

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

米ファイザーと独BioNTechの新型コロナウイルスに対する革命的なmRNAワクチンの接種が明日から始まるが、このワクチン開発にいたるまでの経緯が実に感慨深いので紹介してみる。まさに、大逆転ストーリー。1/22

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

そういえば、私が小学6年の時、先生が 1x0= 1÷0= と黒板��書いて児童に解答を呼びかけたところ、私以外全員が両方とも0と答えて、そのまま先に進めようとしたことがあった。それで、私は何故1÷0が0でないか以下のような説明をした。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

その昔、團勝磨という研究者がいまして、三井財閥の総帥となった團琢磨のご子息なのですが、東大卒業後、ペンシルバニア大学で発生生物学で1934年に学位をとり、ウニの細胞分裂の研究をされていました。留学中に一緒に研究していたジーンさんと恋におち、彼女と結婚して日本につれて帰ります。1/

砂鉄

@satetu4401

1 year

そりゃおめえ研究者みたいな人類にとってどうでもいい仕事をしてる人間が、商社でクソみてえに面倒な商談をいい感じに纏めて社会に貢献している人間が同じ給料出るわけねえじゃん研究者が10000人死んでも日本は平然と続いていくけど、貿易や商談周りの重要人物が100人死んだら日本人の半分は死ぬよ

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

ともあれ、自分が間違っていることを認めることができないという立場の人を説得するのは、まず「間違っていても大丈夫」という心理状態になってもらわなければならないのだろうな、というお話でした。9/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

それ以降も、尊敬はするものの、自分の間違いを認めない指導者の方々には数多く出会ったのだが、アメリカでポスドクしていた時のボスが、これまで出会った人の中でも最高に優秀な人なのに、気軽に自分の非を認めたり、自分の至らなさをオープンに語ったりする方だったので、強い影響を受けた。7/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

しかし、オミクロンに対して、mRNAワクチンの2回接種では変異に対応できる抗体が十分に作れないけれど、3回接種ではちゃんとできてくるって、免疫システムって本当に不思議で想像を超えてくる。オミクロンが発表されて2週間で、幾つも研究チームが同様の結果を公表しているのも凄まじい。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

思いつく限り、自分が男性であること（また、他の様々な面）で下駄を履かせてもらったと思えることをあげてみます。あまりに恵まれすぎて恥ずかしいので、あとで消すかも。

Hiro Nakagami 中神弘史

@Grandpa_Hiro

5 years

@KeikoUTorii @KenichiTsuda4 この議論のために自問してるのですが、自分も比較的変則的なキャリアで、自分のアカデミアでのこれまでのキャリパスにおいて、どこで性別に関わる下駄の恩恵を（潜在的にも）受けていたのかを見出したいです。大学に入る段階で既にというのは有り得ますが、思いつく範囲で指摘して頂けると嬉しいです。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

最悪の事態は、選手が遠慮してワクチン接種せずにオリンピック開催すること。とにかく、誰でもワクチン接種の機会が回ってきたら、遠慮せずに堂々と接種して、ついでに宣伝して下さい。順番を気にしすぎると、またややこしい断絶がおこる。できるだけ多くの人ができるだけ早く接種することが最優先。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

It is perplexing to see that the article ignores tactics of Japan, where R0 of COVID-19 is clearly lower. The purpose of this thread is to search for reasons why Japan has been successful. 1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

2 years

Just before I departed my postdoc lab to become a PI, my advisor Andrew Murray told me - "If you sleep with your student or postdoc, I will shoot you". It was one of many memorable advices that he gave me (and it has been the easiest one to follow).

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

日本で指導者の立場の人が間違いを認める状況というのは、謝罪会見のようにあまりにも高い心理的ハードルが設定されている様にも思われる。『半沢直樹』の土下座のように、誰かを謝らせて溜飲を下げたいという欲求も強い気がする。8/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

@BloombergJapan これは日本語訳のタイトル、抜粋とも酷すぎます。原文タイトルは"Southeast Asia Detects Mutated Virus Strain Sweeping the World"。「世界中で広がっている株が、東南アジアでも見つかった」という記事です。10倍高い感染力という話も根拠はないことが原文を読めば分かります。修正すべきです。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

1÷1=1 1÷0.1=10 1÷0.01=100 割る数を減らすと、答えはどんどん大きくなっていくのに、一番小さな0で割ると突然答えが0になるのは、おかしい。つまり、答えは、0で割る事はできないので、解なしです。2/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

日本は第2波が各地に襲いかかっている状況。欧米から3月初旬に入ってきたのが広がっているということか？ Second waves are hitting at multiple locations in Japan.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

@aqua2015081 @sayakatake それは想定内です。私は、「識者」的な立ち位置の人たちが、それに乗っかる形で、対策の手助けをするどころか、足を引っ張っる非生産的な発言を百家争鳴的に出している状況に憂慮しています。今、必要なのは、正確な情報・専門的知識・知恵・技術・（人的・金銭的）協力です。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

まあ、先生が自分が間違っていたことに気づくことができる説明はできたわけだ。しかし、先生は自分が間違っている事を、他の児童の前では認められなかった。先生は絶対正しくあるべきだという緊張感を持ってクラスを統率されていたからだろう。 6/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

周囲から先駆的研究の価値を認められずとも、先駆的な論文を出し、人類の医療に多大な貢献をし、しかもオリンピック金メダリストの娘さんを育てられたKarikóさんもハンガリーからの移民。こういう人がいると、少々の障壁でへこんでる場合でないと思った次第である。22/END

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

このmRNAワクチンが画期的なのは、他の病原体や癌治療、遺伝子治療など広い応用が可能な点だ。今回のmRNAワクチンで十分な安全性が確認されたならば、コロナ禍があったからこそ、人類は新しい医療技術を手に入れたということが言えることになるかもしれない。21/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

「ここは小学校なので、難しい話はちょっと控えてね」という感じのことを言われた。その先生は非常に熱心で全体的には「いい先生」であり、特に酷い扱いをされているわけでもなかったので、私は「はい」と言ってそれ以上は黙っていた。 5/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

Twitterでは、できる限り負の感情は出さないようにしていますが、アルコールが入って勢いで書いてしまいました。百点満点の落としどころについて興味がある方は、こちらのスレッドもどうぞ。

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

新型コロナウイルスに対するワクチンや治療薬が、もし開発できないとしたら？集団免疫(herd immunity)をキーワードとして、国家が対処する極端な二つの戦略を考えてみる。副読書として、ジャレド・ダイアモンド『銃・病原菌・鉄』とオースン・スコット・カードのSF『死者の代弁者』を薦めたい。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

我ながら分かり易い説明だったと思ったが、先生がクラスの児童に再度問いかけたところ、誰一人1÷0=0という解答を変更したものはいなかった。自分の意見や説明が納得してもらえないことはいつものことなので、しゃあないと思ってそれ以上は特に抗弁することはなかった。3/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

2 years

昨年３月に東大定量研で、「研究を楽しむための対話」というタイトルで１時間お話したのだけど、かなり準備した割には一度きりの講義になってしまいそうなので、つくったスライドの一部を紹介します。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

その後、テスト中に、先生が私のところに来て、「さっきのは誰に教わったの？」とヒソヒソ声で尋ねてきた。実は、数字は0で割れないという話は、土曜学校に来ていてた大学生から聞いていたので、「大学生の人です」と答えると、 4/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

mRNAワクチンを2回接種してもオミクロン変異に効果のある中和抗体はできなかったが、3回接種すると有効な中和抗体が作られた。その謎を解くヒントをロックフェラー大チームがプレプリントで報告。1/

Frauke Muecksch

@FraukeMuecksch

3 years

1/ Our new work on antibody immunity following SARS-CoV-2 mRNA booster vaccination provides insight into why a 3rd dose of a vaccine that was not designed to protect against variants is so effective at preventing severe disease after Omicron-infection.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

情報が指数関数的に増加している現在、膨大な知識を整理して、誤解のないように伝える能力、さらに重要な発見を見極める能力を育てる必要が増しているとはいえないでしょうか？情報を見極め活用できる次世代の研究者を育てないと、我々は誤った情報で大衆を操るデマゴーグに対抗できません。8/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

研究者自身も、自らが社会に対して果たす役割について、言葉を用意しておく必要があるのではないかと思います。人それぞれだとは思いますが、１つの見方を書いておきました。9/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

「ファクトに基づくわかりやすいモデルで新型コロナの特性を説明」したとするこの記事。一週間前FBで友人が「説得力がある」と紹介していていて気がかりだったのだが、続編も出たようなので、お節介ながら検証しておく。1/16

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

Imperial College COVID-19 Response Teamによる、新コロナウィルス/COVID-19の英国、米国での感染シミュレーション解析。生命医学系の方々は、論文を読んで、何か見通しに誤りがないか確認してほしい。それほど、ゾッとする内容だが、やるべき提案もしている。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

新型コロナウイルスに対するワクチンや治療薬が、もし開発できないとしたら？集団免疫(herd immunity)をキーワードとして、国家が対処する極端な二つの戦略を考えてみる。副読書として、ジャレド・ダイアモンド『銃・病原菌・鉄』とオースン・スコット・カードのSF『死者の代弁者』を薦めたい。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

辛いことがあったとき、音楽、芸術、スポーツ、料理、物語などが活力を与えてくれるように、研究者たちは身の回りに溢れている不思議を調べることを通して、できるだけ多くの人が、この世界を面白がってもらえるように努力しています。7/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

音楽、芸術、スポーツが、人種や国籍を超えた繋がりと感動を生むように、この世の中のありとあらゆる「なぜ・WHY？」「どうして・HOW？」という疑問に答えようとする研究も、時をこえて世界中の人��と感動を分かち合うことができる手段となりえます。5/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

わたしたち研究者は、人類が歴史を通じて築いてきた知識の塔を発展・継承することを通じて、この世界からできるだけ多くの驚きと感動を体験してもらうための手助けができるように働いています。6/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

まずは、なぜこのmRNAワクチンが革命的であるかについて。一つは凄い効果。 2万2千人のワクチン接種者と、同数の偽薬（プラシーボ）接種者で二回目の接種からの感染者数を比較すると、偽薬接種者では162名が感染したのに対し、ワクチン接種者では8名。実に95%の予防効果！ 2/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

報道では、有名製薬会社ファイザーの名前に隠れがちになるが、mRNAワクチンの技術的基礎を作ったのはドイツのBioNTechだ。創設者のUgur SahinとÖzlem Türeciの夫妻は、二人とも幼少時にトルコからドイツに移民してきた。彼らは、元々mRNAワクチンによる、癌の免疫治療に注目して研究をしていた。16/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

そして、革新的な技術が高い効果と開発スピードを可能にした。しかし、この新技術の有用性が認められるまでの道程には、一時は挫折の崖っぷちまで追い込まれた女性研究者の存在があった。当時、ペンシルバニア大学の教授であったKatalin Karikóさんだ。5/

BioNTech scientist Katalin Karikó risked her career to develop mRNA vaccines. Americans will start...

For more than a decade, Katalin Karikó struggled to convince colleagues that mRNA vaccine technology could work.

www.businessinsider.com

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

人工的に作ったmRNAに化学修飾を施しておくと、mRNAを細胞内に導入しても自然免疫システムを発動しないことが分かった。この発見は2005年に発表されたが、当初それほど注目されていなかった。14/

Suppression of RNA recognition by Toll-like receptors: the impact of nucleoside modification and...

DNA and RNA stimulate the mammalian innate immune system through activation of Toll-like receptors (TLRs). DNA containing methylated CpG motifs, however, is not stimulatory. Selected nucleosides in...

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

効果と安全性がこれ程早く検証できたのは、感染による致死率が高かったことにより、数万人規模の被験者の獲得が容易だったことと、感染抑制に失敗した国では（偽薬投与）被験者での感染が短期間で十分に認められたこと。感染が蔓延していないと、短時間ではなかなか効果を確認できない。4/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

追記: 多くの方に読まれ、日曜日の午後を潰した甲斐がありました。ちなみに、私はこれらのワクチン開発関係者と利害関係(COI）も面識も全くありません。株も、祖父の「株だけは手を出すな」という言葉を馬鹿正直に守って、どこの株も一株も持っていません。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

二つ目の理由がスピード。新型コロナウイルスの遺伝子情報が公開されたのが今年1月10日。4月29日に治験が開始して、僅か7ヶ月後の12月11日に認可された。3月の時点では早くて1年と言われていたので驚異的なスピード。3/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

日米開戦後も、アメリカ人のジーンさんは日本にとどまります。終戦直後は、駐留軍と地域の住民の中をとりもったりされます。團勝間の弟子たちの論文の英文校正をひきうけながら、自らもウニの受精の研究を続け、お茶の水大学で教鞭をとられます。2/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

そこへ到来してのが新型コロナのパンデミック。BioNTechは蓄積していた技術と、すでにインフルエンザワクチン開発で提携したファイザーと組むことにより、この新技術の安全性チェックのための大規模治験を短期間でクリアしてしまった。19/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

2013年、BioNTechは、それまで大学からの支援を得られず、mRNAワクチン開発競争の蚊帳の外におかれたKarikóさんを、にsenior vice presidentとして迎え入れる。ペンシルバニア大学の同僚に、BioNTechのウェブサイトがまだ無いことを知って笑われたという。18/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

終戦時、東大三崎臨海実験所が進駐軍に接収される際、團勝磨は"The last one to go"という張り紙を書いて、米国ウッズホール海洋研究所を例にあげながら実験所の保全をうったえました。この文章は進駐軍の胸をうったようで、Times誌にとりあげられました。3/

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

團勝磨は、米国留学時にアメリカ人女性と恋におち、再渡米して結婚して日本につれて帰った。これが戦前の1936年のこと。終戦直後、潜水艦基地として使われていた東大三崎臨海実験所を進駐軍に明け渡す際、"The last one to go"という手紙をドアにはって保全を訴えたところ、Time誌にとりあげられた。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

ここで宣伝するとしたら、"Bending the Arc"というドキュメンタリー映画かな。素晴らしいです。

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

昨晩Netflixで観た"Bending the Arc"、日本語字幕もあるので是非多くの人に観て欲しいですね。「出来ない理由」を探して潰そうとする声に対して、信念をもって途上国の医療改革を実現させていく医師達のドキュメンタリー。高校生の頃観てたら、医師を目指したかもしれない。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

團勝磨のお弟子さんの井上信也さんは、そのウッズホール海洋研究所で自ら開発した偏光顕微鏡で有糸分裂のダイナミクスの研究で画期的な成果をあげられ、米国細胞生物学の発展にも大いに貢献されました。團さん、井上さんから続く生命の不思議を研究する者たちの交流は、今に引き継がれています。4/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

今後、実際のワクチン製造、運搬、保管などの技術的問題、数百万、数千万単位でのワクチン接種でどのような副作用が出るか注視する必要があるが、新型コロナウイルスによる致死率とワクチンの高い防御効果を天秤にかけると、高リスク層からの積極的接種には大いに期待できる。20/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

KarikóとWeissmanは特許を取り、会社を立ち上げたが大学は2010年にライセンスを売ってしまった。しかし、この発見を見逃さなかった研究者たちいた。現在mRNAワクチン開発をリードするBioNTechの創設者Ugur SahinとÖzlem Türeci、Modernaの設立に係わったDerrick Rossiだ。15/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

実際、人工的に作ったmRNAを細胞に導入すると自然免疫システムが発動してしまう。しかし、一方、細胞内に元々ある自分自身のRNAは自然免疫を発動しない。何故か？ここでKarikóは、細胞内のRNAは様々な化学修飾を受けていることに注目した。13/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

ところが、このアイディアは長い間研究者たちには不可能と考えられ、Karikóさんは研究費申請でことごとく失敗した。研究費を獲得できなったKarikóさんは、常勤から非常勤教授へと格下げとなった。11/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

旧来のワクチンは、弱毒化した生ワクチンや、不活性化ワクチンが主流だった。弱毒化や不活性化には、ウイルス固有のノウハウの蓄積・検証が必要。ウイルスの扱い・操作もリスクがある。6/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

あるタンパク質の配列情報をコードするmRNAを細胞に取り込ませることができれば、細胞内のタンパク質合成装置であるリボソームがmRNAの情報を読み取り、目的のタンパク質を作らせることが可能だ。そのタンパク質は「異物」として免疫細胞に認識され、それに対する抗体が作られる。10/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

二人は企業家でもあるが研究者であり、インパクトのある研究論文を連発していた。しかし、mRNAワクチンの実用化はなかなか軌道に乗っていなかった。新技術に対する副作用などの警戒に加え、mRNAの不安定性ゆえの超低温での保存などがネックになっていたことは想像に難くない。17/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

ウイルス感染防御に効果的な中和抗体は、主にウイルス表面のタンパク質（コロナの場合、スパイクタンパク質）を標的としている。抗体がスパイクタンパク質に結合してブロックすると、ウイルスは細胞に感染できなくなる。7/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

抗体ができるためには、抗原提示細胞が「異物」を取り込み、その一部を細胞表面に提示して、免疫細胞を活性化する必要がある。コロナウイルス全体でなく、スパイクタンパク質だけ異物として細胞に取り込ませることができれば、感染せずともスパイクタンパク質への抗体をつくることが可能となる。8/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

厚労省がファイザーとmRNAワクチン提供で基本合意したのは2020年7月31日ですからね。その時点で、アストラゼネカ、モデルナとも交渉を進めていた。ちゃんと情報を見極めて政府に説得できる力を持っている人（たち）は厚労省にいたわけです。ほんまもののプロの仕事。

新型コロナウイルス_ワクチン情報

@VaccineWatch

3 years

同感です。11月の時点でも大規模臨床や非臨床試験の結果から、有効性と安全性に関しての知見はかなり充実していました。臨床試験の内容に関する事実誤認もあり、当時の彼のメッセージは良くなかったと今でも思ってます。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

しかし、新しいウイルスタンパク質だけを大量生産して効果的なワクチンをつくるのは技術的に難しかった。タンパク質の性質は配列によって大きく変化するので、実験してみなければ分からない部分が大きい。Karikóさんが注目したのは、タンパク質を作る情報の鋳型であるmRNAだ。9/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

以前、COVID19にノーガードで早期集団免疫獲得を目指すA国と、鎖国を含めた社会行動抑制・行動監視による感染封じ込め策を取るZ国という、極端な二つの戦略を検討してみた。3ヶ月たって、実際の経過と比較しながら中間総括することにした。長いです。 1/40

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

新型コロナウイルスに対するワクチンや治療薬が、もし開発できないとしたら？集団免疫(herd immunity)をキーワードとして、国家が対処する極端な二つの戦略を考えてみる。副読書として、ジャレド・ダイアモンド『銃・病原菌・鉄』とオースン・スコット・カードのSF『死者の代弁者』を薦めたい。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

全く気の毒な話だが、日本は大学院生がもっと気軽にラボを変更できたり、別の教官に相談できるシステムをつくらないと。米国の話だが、大学院５年目でラボを変更して、Science誌に筆頭著者で論文を出して無事学位をとった人を知っている。とにかく、色んな意味でドアは開けておく必要がある。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

外部から導入された「異物としてのmRNA」は不安定ですぐ壊れてしまい、目的のタンパク質を生産できない。さらに、細胞は、ウイルスなどの外部から進入してきたRNAを認識し、感染防御する自然免疫のシステムが働いて炎症反応をおこしてしまう。12/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

ある日本在住の高齢者の方が、「ワクチンには何だか抵抗感があって、インフルエンザのワクチンも受けたことないし、今更いいかと」おっしゃっていたので、新型コロナに対するワクチン接種の意義について説明した長文のメールを送ったところ、納得して頂くことができました。参考になれば幸いです。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

自分が理解できないからといって、どうしてその道のプロを叩くのだろう？ワクチンも特効薬も無いのだから、医療機関の負担を下げるため、接触を減らして感染ピークを下げるのが基本。感染数が下がればクラスターも追い易くなる。それとも、みんなマイクロチップ埋めて行動を監視してもらいたいのかな？

grace*no war / nukes

@mitsuko_to

4 years

NHKスペシャル。キャスターが西浦氏に突っ込み。「感染ルートを追えない患者がたくさん出てきたということは、これまでの対策を変えないといけないということ？」西浦氏「基本的には変わらない。接触を減らして感染が追えるくらいに抑え込むこと」え？感染がここまで広がった後でそれできるの？

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

欧州医薬品庁がファイザー・ビオンテックmRNAワクチンの未開封バイアルの冷蔵保存可能な期間を、これまでの５日から１ヶ月まで延長することを決定

Ryan Cross the Science Boss

@RLCscienceboss

3 years

So maybe all the fuss about mRNA vaccines being incredibly fragile and unstable wasn't really worth the fuss? After more testing, Pfizer and BioNTech determine that their COVID-19 shot is stable at 2-8°C (fridge temp) for a month (up from 5 days).

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

臨床試験で重症化防止に極めて高い効果を示したPfizerの抗新型コロナウイルス薬であるが、その開発には奥深い科学の叡智が集積された結果であることが最近Science誌で公開された論文で知ることができる。とても勉強になったので少し紹介してみる。1/

An oral SARS-CoV-2 Mpro inhibitor clinical candidate for the treatment of COVID-19

PF-07321332 is an orally active, small-molecule inhibitor of the SARS-CoV-2 main protease that is in clinical trials for the treatment of COVID-19.

www.science.org

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

とうとうNew York市内の各所で、16歳以上なら誰でも予約なしにワクチン接種できるようになった。

Mark D. Levine

@MarkLevineNYC

3 years

BREAKING: All City-run vax sites in NYC are open to walk-ins of all ages, as of today.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

この話を妻と話してたけど、結局、アカデミアでの成功に大事な技術の一つは、ストーリーテリングの能力なんだろうなと。いくら試験で良い点数をとれて、知識があっても、物語を紡ぐことができなければ、技術者として活躍するしかない。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

COVID19陽性者件数が100を越えた時点を基点としたエピカーブ。東京の陽性率が高いのはデータとして懸念材料だが、米国でうまく対処したと言われているワシントン州と遜色ない。大阪、兵庫、福岡などは陽性率も20%を切っており、各地方自治体のクラスター対策における健闘が伺える。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

ジョージア州での子供たちの宿泊キャンプで、260人の大量クラスター感染報告。スタッフはマスク着用していたが、子供たちはマスクをせずに歌って遊んで、複数が同じキャビンで宿泊。子供同士の感染は起こると考えた方が良さそう。

Amy Maxmen, PhD

@amymaxmen

4 years

-*Out of 597 campers & staff, 344 were tested and 76% of those tests were positive -26% positives report no symptoms -Bottom line from @CDCgov : Children of *all* ages are susceptible to #SARSCOV2 & "might play an important role in transmission" Paper online soon & here (2/2)

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

人口の40％が既にファイザー・ビオンテックmRNAワクチンを少なくとも一回受��たイスラエル。素晴らしい抑制効果が出ているという結果が出始めている。詳細データをファイザーとWHOに提供するという条件で、イスラエルが優先的ワクチン供給を受ける合意を政府が取り付けた。

The secrets to Israel’s coronavirus vaccination success

The country has already vaccinated 20 percent of its population.

www.politico.eu

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

新型コロナワクチンを、3週間の間隔を開けて２回接種するという認可されたスキームに対して、できるだけ多くの人にまず1回接種するべきではないかという議論がタイムラインを賑わせているが、そのスキームが引き起こしかねない問題をロックフェラー大のウイルス学者 @PaulBieniasz が指摘している。1/9

Paul Bieniasz

@PaulBieniasz

4 years

Musings of an anonymous, pissed off virologist.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

1 year

久々にバズったので、このインシュリン発見の影の立役者についてのスレッドを宣伝させてください。

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

今日、Jeff Fridemanさんが、インシュリンの発見への先駆的な研究結果を発表するものの、不幸が重なり研究を諦めざるを得なくなったIsrael Kleiner博士の感動的な話をしてくださいました。このエッセイも素晴らしいですので、ポイントを日本語で紹介してみます。 1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

オミクロンを医療従事者が怖がる理由は、自分が感染したまま医療行為を続けると、高齢者や抗がん剤治療をしている患者など免疫機能が低下している高リスク者を危険にさらすことでは？コロナに感染した医療従事者が急増すると、医療崩壊するのは明白。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

この記事は頷くことばかり。こまめな消毒、アクリル板、マウスガードとか、いわんや空間消毒など効果が薄いことに金と労力を使いすぎ。土俵で塩を撒いているようなものだと思う。換気の悪い屋内で感染者がマスクをせずに話したなら、その空間での感染を防ぐのはとても難しいということ。

zeynep tufekci

@zeynep

3 years

The WHO just updated its page on how COVID-19 transmits. Those few sentences on aerosols represent one of the most crucial scientific advances of the pandemic. My NYT piece on the century-long history of the error, the year of delay—and what it means now.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

経済学専攻大学院生（主に非ネイティブ英語話者）が書いた論文を、プロ校正者が内容を変えずに文章を直したら、専門家の評価も上昇することを示した論文。 Appendix Bの「文章を読み易くする校正ポイント」は参考になるだろうし、この論文自体読み易いので是非一読を。

Jan Feld

@EconFeld

3 years

Does academic writing matter? Does better writing cause our peers (eg as referees and journal editors) to evaluate our papers more favorably? Our paper “Writing Matters” (with @CorinnaRGL and Libby Ross) suggests it does! #EconTwitter . A thread. (1/11)

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

人の批判ばっかりしていると自己嫌悪に陥るのですが、さっき目にとまったのはあまりにも酷いので簡単に紹介しておきます。マスク着用ポリシーの有効性を示したとするPNASの論文。1/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

昨晩Netflixで観た"Bending the Arc"、日本語字幕もあるので是非多くの人に観て欲しいですね。「出来ない理由」を探して潰そうとする声に対して、信念をもって途上国の医療改革を実現させていく医師達のドキュメンタリー。高校生の頃観てたら、医師を目指したかもしれない。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

バズっているので、時間をかけた割に全く読まれなかった死生観についての文章をおいておきます。長いし難解かもしれません。この先生がご存命かどうかは分かりませんが、情熱あふれる先生でした。こうやって書くことにより、先生が生きていることになるという様な話です。

Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

通りすがりのものですが、死生観について書いてみました。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

@BloombergJapan 原文リンクはこれです。

Southeast Asia Detects Mutated Virus Strain Sweeping the World

Southeast Asia is facing a strain of the new coronavirus that the Philippines, which faces the region’s largest outbreak, is studying to see whether the mutation makes it more infectious.

www.bloomberg.com

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

9. 妊娠、出産による仕事の中断は、限定的だったし、それによるキャリアパスの変更を考えるオプションは頭になかった。育児や家事を「手伝う」という感覚だった。「父に比べて、良くやってるのでは？」という甘えがあった。子供を保育園に預けて、引き裂かれるような思いはなかった。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

10. 職場でセクシャルハラスメントを受けたことはなかったし、そのような心配をすることはなかった。ボスや親しい先輩と二人で食事したり酒を飲みながらながら話こんで、研究やキャリアの相談をするのは自然だった。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

14. 振り返ってみると、 @KeikoUTorii さん等、リーダーシップを発揮されている女性研究者の方々に比べると本当に甘くて汗顔の至りです。高い下駄を履かせてもらい、時代の波に乗る幸運にも恵まれ現職を得ましたが、貴重な経験もさせて頂いてきたので、なんとか還元できればと思っています。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

東京都で新規に確認された週間陽性患者数は、既に減少傾向にある様です。一方、検査件数は増えていて、4/16-22の陽性率は12.3%と低水準。（ただし、実際の数字はそれより若干高いはず）。まだまだ安心できませんが、東京都の皆さんの努力は数字に出てますよ！

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

13. もし、多くの女性が科学者になることを望んでいないのなら、彼女らに対して申し訳ないと思わなくとも良いとの意見もあるかと思うが、この宇宙で生きる機会を得た以上、この宇宙の諸事象を科学的に解釈するための知識と技術を学ぶ機会が、女性であるために失われているならば、申し訳ないと思う。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

以上の様なことを考えると、この新コロナウイルスに対する戦略で、何を正解とするかは難しい問題であることが分かるのでは？ A国策とZ国策では、違う人が得をして損をすることになる。だからこそ、例え多数の犠牲者が出たとしても、安易に戦犯探しをするのは避けたいと思う。16/

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

ロックフェラー大学では、週一で全学職員学生をPCR検査していますが、mRNAをワクチンを受けて2週間以上たった417人のうち、2人が有症状感染した例の報告。いずれも変異型で、ワクチンによって中和抗体が出来ていたのにも関わらず感染発症した。ワクチンは効果はあるが、特に変異型には完璧ではない。1/

Rockefeller University

@RockefellerUniv

3 years

Two new cases helped the @darnelr lab confirm what many suspected: people can get infected by SARS-CoV-2 variants even after successful vaccination. The findings suggest continued testing may be needed to prevent future outbreaks in a post-vaccine world.

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

1. 私は京都出身だが、当時、東大・京大に入学者を多数輩出する「進学校」は、京都はおろか関西では男子校しかなかった。私の通った私学では、素晴らしい英語や化学の先生方に出会えたことが今でも役立っているし、水泳部の顧問の先生にみっちり体を鍛えて貰った。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

スパイクタンパク質に応答する記憶T細胞は、ワクチン接種半年たっても機能低下がみられなかったことからも(最新プレプリント）、ワクチン接種による重症化予防効果は長期間持続すると予想される。3/

Low dose mRNA-1273 COVID-19 vaccine generates durable T cell memory and antibodies enhanced by...

Understanding human immune responses to SARS-CoV-2 RNA vaccines is of interest for a panoply of reasons. Here we examined vaccine-specific CD4+ T cell, CD8+ T cell, binding antibody, and neutralizing...

www.medrxiv.org

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

タブーを廃し、自由闊達な意見を交換できる場は、科学にとって非常に重要だ。しかし、市民行動のちょっとした差が、大きな影響を及ぼすことになりかねない新型コロナウイルスに関して、根拠の乏しい仮説を発表することの問題について、メディアの方々はよくよく考えていただきたいと思う。16/16

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

同感 1月にNYから京都に一時帰国してた友人は、飲食店が盛況でビビっていたのですよね。台風や津波は、どれだけ皆で協力しても進路を変えられないけれど、コロナ感染は皆が一致団結して協力すれば防ぐことができる。医療関係者、高齢者のワクチン接種が進んで医療崩壊が回避できれば、一息つけます。

木下喬弘 / メディキューCEO / エピタップ代表

@mph_for_doctors

3 years

改めて・手洗いマスク三密の回避は科学に基づいた感染対策であり、タケヤリと揶揄することは不適切・クスリに頼ること自体が科学的ではなく、世界中どこを見ても「感染しても安心」といえる治療薬を開発した国はない・メディアも「ワクチンは根本的な解決策」という情報提供をすべきだと思います。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

12. 必死で勉強し、研究に集中し、一人で海外に出て研究者となることに対し、否定的なことを言ってくる人は、一人もいなかったし、家族や多くの友人に期待され応援してもらった。自分が得た成果は、自分の努力によるものが大きいと勘違いしたこともあったが、それを諫められることはほとんど無かった。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

6. 人間は、声が高いと、幼さを無意識に感じてしまう。声が高い女性より、声の低い男性の方が、権威を感じやすい。（特に、知名度のない人の場合）意識していないとバイアスがかかる可能性がある。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

予想通り、ワクチン接種者や既感染者で記憶されたT細胞は、抗体産生B細胞に比べて、オミクロン変異による影響は小さいという南アフリカの研究グループからのプレプリント報告。ワクチンで訓練、記憶されたT細胞は、感染後のウイルス増殖を防ぎます。

The Virus Monologues✊🏾🇵🇸

@virusmonologues

3 years

We have new results on T cell responses to #Omicron , and its good news! Paper submitted for peer review & preprint: 📢TL;DR: Most of your T cell responses from vaccination or previous infection still recognise Omicron. #Getvaccinated #GetthoseTcellsnow

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

5. 日本語の言葉遣いや慣習は、雛人形の位置・風呂の順番から結婚後の姓の選択まで、女性より男性が上位にたつように出来ている（た）。西洋でも、女性は男性に守られるべきものという価値観が社会的に浸透しているし、そう思っている女性もいる。歴史的に著名な指導者・科学者は、男性が多い。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

2. 主夫になるというオプションは、想像したことすらなかった。幼稚園から、天才的な同級生の男の子（現・東大教授）と友人となれたし、中高でも、志の高い友人に多数恵まれた。つまり上昇志向で迷い無く集中して、全力投球出来る環境があった。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

4 years

子供2の学校。新年明け1週間は全校生徒オンライン授業。一昨日の金曜日に全職員、生徒を学校でPCR検査。4名の陽性を確認。明日、月曜日から、登校、オンライン半々のハイブリッド授業を再開。月曜日から職員はワクチン接種。ほぼ文句のつけようが無い対策。

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

3 years

昨年3月、新型コロナウイルス感染患者の急増でNew York市が医療崩壊の危機に陥ったとき、市の公設病院New York City Health + Hospitalsがどう対応したのか。昨年8月に出された報告書であるが、実に興味深く、感動的ですらある。1/19

Staffing Up For The Surge: Expanding The New York City Public Hospital Workforce During The...

Confronted with the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, New York City Health + Hospitals, the city's public health care system, rapidly expanded capacity across its eleven acute care...

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

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Hironori Funabiki

@HironoriFunabi1

5 years

8. 海外で単身ポスドクに出て行くことに両親は全く抵抗がなかった。（一方、女性であることから、結婚するまで実家から離れることを許されなかった人を知っている。）

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Hironori Funabiki