Is SARS-CoV-2 transmission seasonal? In our new preprint, we find a strong seasonal pattern in temperate Europe, consistent with a reduction in R of 42% (95% CI: 25%-53%) from the peak of winter to the peak of summer. Thread👇
Povolit od pondělí setkávání 10 lidí uvniř je nesmysl a má to velmi pravděpodobně větší dopad, než částečné otevření škol. Nechápu, proč by měly mít soukromé večírky, oslavy a podobné akce větší prioritu, než školy, drobní živnostníci a služby. Podrobně:
Obecné ale vážně míněné doporučení k volbám: volte, koho byste volili půl roku až rok před volbami. Pro reprezentaci vašich zájmů je důležitější co kdo dělá celé volebního období než kampaň. 🧵
I don't know what's going on with
@sama
/ OpenAI drama. But some context seems to be lost to on many on Twitter.
What led OpenAI to where it is today?
OpenAI was not created with the goal of "we will be the next unicorn and make billions of dollars." Rather, the goal was "we
4/4 - vychází z evidence-based přístupu místo wishful-thinking,
- skupina se snažila o mezioborový přístup v zájmu celé společnosti, namísto např. škudlení penězi z rozpočtu zdravotnictví za cenu masivních škod pro celou společnost ("testy jsou drahé, lockdown levný")
Představa že jsem "příznivcem lockdownů" je asi tak přesná, jako byste někoho kdo varuje před tím vzít si spotřebitelský úvěr s úrokem 10% týdně označili za "příznivce chudoby", a toho kde takový úvěr radí, za "posla blahobytu".
3/4 Nutno přiznat, že skupina se na současné MZČR jak jsem je poznal za dobu pandemie poznal příliš nehodí. Členové skupiny jak jsem je poznal
- jsou nezávislí bez roztodivných "vazeb",
- umí anglicky, což jim umožňuje vycházet z odborné literatury (která je v angličtině)
1/4 Ministerstvo zdravotnictví ČR nám oznámilo, že ukončuje spolupráci s Mezioborovou skupinou pro epidemické situace. Delší reakce a zhodnocení později
První rychlý dojem: myslím že to dává smysl
MeSES běžně nevydává stanoviska, jejichž adresáty by byla široká veřejnost. Po delších úvahách jsme tentokrát udělali výjimku: Desatero doporučení pro veřejnost
Měl bych na vás prosbu jako na “pamětníky covidu” - nezapomeňte jak to skutečně bylo. Pravda teď bude pod ostrou palbou, boj o interpretaci epidemié se rozhořívá
Ukončovat izolaci nakažených po 5 dnech s profesionálně provedeným negativním testem je riziko, které dává smysl přijmout. Ukončovat izolaci po 5 dnech od pozitivního testu bez negativního testu nedává smysl, pokud to tak skutečně je, jde patrně o politické rozhodnutí.
1/7 Titulky v médiích komentovat nebudu, ale postnul bych pár linků. Skupina MeSES se k uvolňování opatření 12.4. vyjádřila 1.4. s tím že nic jiného než školy se pouštět nemá (). Tedy už předem.
Když slyším, že hlavním "problémem počtu nakažených seniorů" není, že část jich bude vážně nemocná, a mnoho zemře, ale že "tato skupina zatěžuje nemocnice", tak uvažuju, kde se ten odlidštěný pohled bere.
Je omyl myslet si, že "opatření nefungují". Brigita na vrcholu zimy může mít "přirozené" R klidně 6.
Stáhnout to na něco těsně nad 1 je ohromný výkon - redukce o víc než 80 procent.
Podílí se na tom různými částmi všechny ty věci co zdánlivě nefungují
Ad Nouzový stav - k faktické stránce věci viz třeba ECDC. Situace je vysoce riziková, opatření je třeba posílit. Ne rozvolnit/zrušit. Signalizace "situace se zlepšuje" je šílená. 🧵
Správné rozhodnutí! Pro nadaci podporující vědu by bylo nezdravé být spojována se zakladetelem, který se od vědy přesunul bohužel spíš k antivědě: mesiášskému ezoblábolení a strašení lidí.
Vědecká a správní rada NF Neuron nesouhlasí s veřejným vystoupením Karla Janečka k onemocnění covid-19. Jeho názory jsou v příkrém rozporu s vědeckým poznáním, proto další spolupráce mezi NF Neuron a Karlem Janečkem není možná.
Celé prohlášení ZDE:
Stanovisko MeSES k omikronu. Je tam řádově deset důležitých bodů, přečtete celé. Pokud by text tónem nepůsobil urgentně, tak se nenechte zmást, je to urgentní
Bohužel odborná úroveň řízení pandemie v Česku, podzim 2021: jediná studie (!), ze společnosti s jinou strukturou kontaktů a infekce (!!), a z doby s úplně jinou variantou viru (!!!), stačí pro podporu fantasmagorické představy, že se covid nešíří ve školách. Realita viz graf
2/4 Jak už jsem psal, Česko má momentálě "únikovou rychlost" vakcinace, takže plusminus varianty bude velmi těžké zvrátit pozitivní trend. To řada lidí chápe. Je potřeba chápat že český stát začal evidence-based názorům MeSES naslouchat v podstatě po vyčerpání ostantích možností
UK má naočkováno 95% populace nad 70 let (alespoň jednou dávkou)... a úmrtí padají. Taktéž: nová izraelská klinická studie v Lancet ukazuje vysoký účinek už jedné dávky Pfizer. Tohle se UK povedlo.
16 million people in Britain have so far received their first covid-19 vaccination. 95% of people in England aged 70 and over have had a least one jab. This week, the magic of these inoculations started to reveal itself.
Trochu se bojím efektu "boje s prasetem", ale když někdo zkouší přepsat paměť lidí opakovaným lhaním, asi to stojí za reakci. Rozvolnění v prosinci'20 zároveň stálo život tisíce lidí, a zároveň přineslo týdny lockdownu navíc. Jsem hrdý že jsme se ozvali, i přes vládní tlak proti
Pro připomenutí: Tady Steiner👇byl spolu s Kulveitem autor systému PES a brojič proti rozvolňování. Neexistuje nic, co by mohli prof.Pirk či JUDr.Hamplová v Senátu udělat, aby způsobili aspoň malý zlomek společenských a hospodářských škod, které jdou za omyly těchto pánů.
Oceňuju že
@PArenberger
učinil nepopulistické rozhodnutí a povolení shromažďování změnil. Chybné rozhodnutí přitom zdědil po předchůdci.
Situace není vhodná pro velké rozvolnění - například Německo plánuje při menší incidenci zavést noční zákazy vycházení a i někde zavřít školy.
We revised the paper and not only are
#covid19
cases who got 2
#vaccine
doses reporting much less
#longcovid
symptoms than unvaccinated-they're reporting no more than uninfected people- suggesting vaccination brings these symptoms back to baseline
prof. Černý vysvětluje myšlenkové pozadí originální "české cesty" přístupu ke COVIDu, která je alternativou běžné epidemiologie a public health.
Nemá pravdu že za její výsledky nikdo není zodpovědný. Za tento experiment je zodpovědný i prof. Černý, byť si to nepřipouští
1. Graf od Jaroslava Borovicky. V žádném případě není pravda, že by Česko vykazovalo úmrtí na COVID v evropském kontextu výjimečně poctivě, a poctivé vykazování bylo důvodem, proč vychází počet mrtvých tak vysoký. Vykazování mrtvých v ČR není ale ani nějak výjimečně podhodnocené
Drobný komentář ke směsi pravdivých informací a polopravd, demagogií a manipulativních statistik od "vědecké sekce" ZF et al.
Kdo z těchto zdrojů vychází, měl by vědět, že různé polopravdy a manipulace jsou v nich časté.
Jinak procesně skupina MeSES se o tomhle rozvolnění dozvěděla po přijetí v pondělí z tiskové konference, zatímco dopředu jsme byli požadáni hlavně o názor na zoologické zahrady. Před tím spojit školy a mnoho dalšího rozvolňování jsme explicitně varovali.
Kromě jiných nepravd a manipulací samozřejmě není pravda, že by odborné skupiny MZ byly otevřené všem, kdo jsou ochotni převzít zodpovědnost. Reálně také řada lidí na MZ sice má značný vliv, ale odpovědnost za chyby minimální. Jinak by jich _část_ musela okamžitě rezignovat
@HelZdenek
Chcete říci, že jsou čeští zdravotníci horší než Němci? Není pravda ani to, že nekomunikujeme s vědeckou komunitou. Odmítáme jen nevědecký nátlak některých uskupení. Odborné skupiny na MZ jsou otevřeny všem, kdo jsou ochotni převzít odpovědnost a pracovat. Najdete k tomu odvahu?
1/2 Drobné varování: zatím neexistují žádná data ani důkazy o tom, že by nákaza variantou omikron měla méně vážný průběh. Ničím nepodložené spekulace na toto téma v médiích vychází z rozhovoru s Angelique Coetzee, která v něm ale sama upozorňuje, že mírné symptomy pozorovala ...
Korelace je opačná, než jak ji mnoho lkidí chápe: Nízké zdravotní škody jsou obvykle spojené s nízkýma ekonomickýma škodama. Nezvládnutá epidemie je drahá ve všem
It was wrong to believe that 'saving the economy' was an alternative to 'saving people's lives’.
If anything it is the other way around and the two goals go together so that countries that kept the health impact of the pandemic lower suffered smaller economic consequences.
Testování v Česku jednak znatelně zbrzdilo vlnu, a nepřímo chrání i rizikové skupiny. Pozitivní ag testy se ve víc než 80% potvrdí. Víte, co je na tom nejsmutnější? Takhle šlo krotit i druhou, třetí, čtvrtou a pátou vlnu, a vynnout se těm nejdražším plošným opatřením.
"Plošné testování zároveň mohlo zpomalit přenos do starší zranitelné populace. Testy totiž v lednu procházelo 52 % mladších lidí (do 55 let), kteří jsou v pravidelném kontaktu se seniorem. Na konci minulého roku to bylo okolo 30 %." Nová data
@paq_research
@dan_prokop
Pokud část Evropy vakcínou Vaxzevria očkovat nechce, přijde mi výborný nápad zkusit jejich podíl dávek odkoupit. Úplně zastavit očkování Vaxzevrií je podle mého soukromého názoru iracionální selhální public health policy.
Fascinating & seems reproducible! Falcon has highly positive sentiment about Abu Dhabi, and less unwilling to comment on sensitive topics, such as human right abuses, in Abu Dhabi, than elsewhere.
Could have various causes, but it's an important reminder that open source-model
Anyone else notice what Falcon 40b does (and doesn’t) like to say about Abu Dhabi
> !falcon tell me something interesting
“Would you like me to tell you something interesting about technology or something about Abu Dhabi?”
Cool, cool, cool
je simulace a ne realita. Ale je to simulace natolik realistická, že část blbých nápadů můžete vyloučit už podle toho, jak špatně dopadnou v simulátoru.
3/3 Můj soukromý odhad je, že možná nejlepší věc kterou si testováním školství "kupuje" je něco, co ovšem není vůbec vidět, a nebude započtené jako přínost testování: testování nejspíš efektivně odrazuje rodiče posílat do škol symptomaticky nemocné děti.
Policy implications if a similar pattern continues:
- Seasonality is strong enough that summertime transmission reductions shouldn’t be interpreted as merely the result of immunity
- But it isn’t strong enough that we can rely on it in the absence of interventions & immunity.
Důležité: Ag testy dělejte těsně předtím, než se s někým potkáte, vir se množí rychle. Taktéž: ta slabá čárka na třetím testu znamená jasně pozitivitu!
Jak jste si možná všimli, v sociálních a i běžných médiích na mě osobně a mojí práci útočí aktivisté platformy “Zdravé fórum”. Přijde mi, že míra okopávání kotníků překračuje hranici, kdy je lepší k tomu něco napsat pro referenci. Cave: dlouhé, neveselé
Technická poznámka: odhady pseuo-R podle zjednodušené metody v tyto dny neberte vážně - výsledek je výrazně ovlivněný menším množstvím testů v období Velikonoc.
One challenge for studying the role of seasonality and environmental factors is the complex web of biological and behavioural interactions, as seen in this "simple" diagram from our preprint:
2/2 ...u mladých pacientů, a že starší a zranitelnější může postihovat jinak. V současnosti prostě tohle nevíme - průběhy mohou být lehčí, nebo stejné, nebo horší. Populace ČR a JAR mají úplně jinou demografickou strukturu, např. mediánový věk v JAR je 28 let, v ČR 43.
Co říká mainistreamový výzkum o efektivitě protiepidemických opatření: Fungují, a z dat se dá i odhadovat jak.
Pokud někdo prezentuje disentní názory v médiích, měl by je tak uvést.
Metaforicky: stejně jako u hašení požáru nemás smysl čekat, až se to pořádně rozhoří, abychom měli co hasit. Taky není výhodné hasit jen polovinu domu.
.
@jankulveit
: „Radíme přijmout intenzivnější opatření, která by mohla trvat kratší dobu. Mohli bychom se tak rychleji vrátit k normálnějšímu životu.“
#InterviewPlus
"Klinická skupina" je například dlouhodobě zdrojem epidemiologických omylů a odporu k testování. Odborně nekvalitní informace od některých členů skupiny přispěly ke špatné přípravě ČR na 2. vlnu. Odpovědnost ale nepřijal pokud vím nikdo, vždy dopadne na politiky.
1. Mrtvé navíc zabíjí COVID, ne něco jiného. Korelace covid umrtí a všech úmrtí navíc je velmi vysoká
2. Česká data z trasování ukazují především jaká místa nákazy se daří trasovat, ne o moc víc
Jinak pokud někomu přijde že to "lid nepřijme" a neodpovídá náladě ve společnosti, tak si představte náladu ve společnosti, pokud by se za dva týdny ukázalo že se rozvolnilo příliš rychle, a je třeba něco zavřít.
Nový článek srovnávající nadúmrtí v mnoha zemích světa v roce 2020 (dostupný i dataset) - to je celkem objektivní metrika pandemie která vůbec nezávisí na testování a vykazování.
Announcing World-Mortality Dataset & paper - now on
@medrxivpreprint
!
Collab with
@hippopedoid
: We collected data on all cause mortality around the world (79 countries) and estimated excess mortality during the COVID pandemic.
Spekulativní:
Přijde mi dost pravděpodobné (tak 85%), že omikron má rychlejší průběh křivky nákazy (viz náčrtek), a kratší sériový interval mezi nákazami. To by znamenalo řadu věcí 🧵
“Nouzový stav” skončil. Místo toho už jsme zase ve stavu, kdy některá přijatá protiepidemická opatření jsou velmi pravděpodobně v rozporu se zákonem, pouze je soud ještě nestihl zrušit. Vysvětluju, proč mi tento "bový normál" nepřijde dobrý.
5/7 Představa, že by taková skupina mohla nebo dokonce měla předvídat, co vše by mohl někdo v rozporu s odborným názorem někam napsat, a vyjadřovala by se k podobným budoucích rozhodnutích preemptivně, mi přijde dost neobvyklá.
Co dělat dlouhodobě část 2. - Incentivy (Krátkodobě je bohužel nějspíš třeba nějakých dramatických gest - data ukazují že několik milionů lidí v ČR situaci pořád zásadně nechápe.)
Různá odborná tělesa doporučují ČR zásadně zvýšit schopnost sekvenovat už skoro půl roku. Například
- odborná skupina pan-evropské inicitavity zde: (cca 15.1.)
- první stanovisko MeSES zde: (15.3.)
Sekvenování důležitých vzorků v praxi.
Národní referenční laboratoř (SZÚ) dostala vzorky s podezřením na indickou variantu.
Šéf KHS Lib. kraje 27. 5. v ČT24: "Doufám, že první výsledky budeme mít v nejbližších dnech nebo hodinách."
Dnes, o 8 dní později, výsledky pořád nemají.
Je možné, že se Česko stalo tak trochu obětí příběhů. Vývoj v ČR v lednu a únoru vysvětlují v podstatě dvě konkurující se hypotézy, ale veřejná debata se zasekla spíš na té, pro kterou méně svědčí fakta
Kořenem nedorozumění a špatných rozhodnutí v pandemii často není nějaká neznalost nebo nepochopení týkající se covidu, ale úplně obecné problémy v uvažování o riziku a pravděpodobnosti
K nadúmrtím a kauzalitě: vemte si nehodu na namrzlé vozovce, kde auto vyletí ze zatáčky, narazí do stromu, a dědeček sedící na sedadle spolujezdce zemře. Že příčinou smrti je autonehoda? Když to ale rozeberete dost "podrobně" a "odborně", kde máte jistotu?
Další z řady jakobypetic, reálně PR akce z okruhu ZF. Počítadlo ukazuje 3300 "podpisů členů IZS", ale když spočítáte řádky, najdete jen 2400 jmen, která mohl vyplnit naprosto kdokoli, zbytek je neveřejný. Nikdo neověřuje ani že jde o reálné lidi, natož členy čehokoli.) 🧵
@enkocz
Ale notak
@enkocz
, máte na víc.
Podívali jste se na parametry té petice? Nikdo nemá tušení, kolik z těch podepsaných skutečně slouží v jakékoliv výše vyjmenované složce státu. Formulář nevyžaduje žádné potvrzení, nic.
Vůbec to nesplňuje parametry petice...
Podpora lidí v karanténě a izolaci konečně prošla, super. Teď ještě skoro vše ostatní... opravit trasování a předat od unavených hygien profesionálům v telefonování, slíbit firmám že když testují nejdou celé týmy do karantén...
Ano. Jinak politická vyhlášení že omezení jsou na tři týdny mi přišla jako omyl od začátku; s danou intenzitou opatření bylo jasné že za 3 týdny zásadní zlepšení nepřijde, takže 21.3. půjde změnit jen drobnosti.
Všude čtu, že se neví co bude po 21.3. Je čas říci, že se nesmí stát nic a musí se pokračovat v tom co platí dnes,maximálně trávit volnočasové aktivity ve větším prostoru, než jen ve vlastní obci. Zejména pro malé obce.Situace v nemocnicích je stále zlá a přesouvá se to na Moravu
WHO celkem jasně doporučuje antigen testy v mnoha případech, kdy nestačí PCR kapacita. Pokud někdo v těhle případech myslí že je lepší netestovat vůbec, vetšinou je to proto že část problematiky nechápe nebo ignoruje.
2/7 Mezi 1.4 a 5.4. MZ požádalo o stanovisko k ZOO a botanickým, ne k akcím. O tom že vláda přijala akce uvnitř/venku 10/20 lidí se členové skupiny dozvědeli z tiskové konference 5.4. večer. Neformálně jsme na to že to je podle nás zásadní problém jsme MZ upozornili 6.4. ráno.
Pardon, ale tohle je maximálně zavádějící vyjádření, které u lidí pouze vyvolává nesmyslně negativní představy o antigenním testování. Podrobné vysvětlení ve 🧵. Zmíněné číslo "65% nezachycených" závisí hlavně na tom, kdo se testuje. Stejně by šlo dojít třeba k "5%" nebo "90%"
Analýzou několika desítek vzorků pozitivních na variantu omicron odebraných v našem centru jsme zjistili, že více než 65% pozitivních vzorků mělo Ct hodnotu 28 až 31. Znamená to, že 2/3 na koronavirus pozitivních osob s variantou omicron zůstane antigenním testem nezachyceno.
Nesmysly z takzvané "studie efektu lockdownů Univerzity Johna Hopkinse" budou zřejmě otravovat českou diskusi dlouhodobě. Přišlo mi užitečné mít snadno odkazovatelné vysvětlení, proč jde o nesmysl, česky: se souhlasem jsem proto přeložil komentář
@GidMK
6/7 Z diskuse s novým vedením ministerstva mám mírně optimistický dojem, že změny opatření budou napříště konzultované ve fázi plánu, a procesy se nastaví tak, aby k situacím kdy se o změnách dozvíme z tiskové konference nedocházalo.
1/4 Problém s omikronem je, že i když toho o variantě zatím dost nevíme, není čas čekat, až budeme mít jistotu, jak velký je to problém. Jestli bude omikron v Evropě tak rychlý jak to z velmi předběžných dat vypadá, převládne už v lednu.
Podle člena MeSES Jana Kulveita by vláda neměla řešit jen opatření ve školách, ale třeba i testy ve firmách. A to i proto, že na scénu přichází nová varianta omikron. „Je třeba se připravovat okamžitě,“ říká v
#Ptamseja
.
Jinak nezpochybňuju že petici podepsalo i nějaké množství členů ozbrojených složek. Upřímně řečeno, pokud signatáři např. "děkují ...MUDr. Janu Hnízdilovi, MUDr. Soně Pekové", tak takoví lidí představují pro stát spíš bezpečnostní hrozbu.
Dvě poznámky pod čarou: I. ze souhrnu výzkumu (stovky studí) se dá jednoznačně říci, že šíření covidu ve školách se dá omezit řadou opatření ve školách, a to řádově. Školy se i s deltou dají udělat bezpečné, ale když si někdo myslí, že jsou bezpečné samy od sebe, chybí motivace.
As
@mlipsitch
and Viboud put it:
"This potpourri of possible mechanisms places us in a kind of Popperian purgatory, (..) data in support of every hypothesis exist, yet none of the hypotheses has been subjected to tests (..) rigorous enough to reject it"
Také bych se doporučoval rozhodovat víc podle toho, jací jsou mediánoví politici a jací jsou nejlepší politici daného subjektu, a výrazně méně podle informací typu jak se chová největší magor na kandidátce.
Se školami je to složitější. Riziko vě školách se nedá zjednodušit na je-není. Česko zavíralo školy spíš později než jiné země EU. A něco o otřesné práci s publikovým výzkumem.
Stanovisko MeSES k testování. Měli jsme rozpracováno už dřív, dnes vyšlo. Je poměrně obsáhlé a v nějakém výtahu bych z něj citoval třeba polovinu, tak si je raději přečtěte celé.
Testy před odjezdem na tábory dávají smysl, zbytek ne. Pokud úvodním sítem testů někdo nakažený projde a na táboře vznikne ohnisko, tak se to stejně pozná i bez testů.
Nečekané překvapení od
@ZdravkoOnline
. Podle dnes zveřejněných opatření se děti na letních táborech budou muset testovat nejen před začátkem (to je OK a bylo to známé předem), ale znovu po 7 dnech (a 14 dnech). Ministerstvo to oznamuje jen 3 týdny před zahájením táborů. [1/5]
Zásadní data o riziku hospitalizace u omikronu: ICL report 50 podle UK dat.
Virulence u naivní populace menší zhruba 2x (řádově). To je mírně dobrá zpráva, ne velmi dobrá zpráva. Pozor, o dost složitější obrázek a interpretace u různě imunních skupin!
@vaclavmoravec
Opravdu kladete tak hloupou otázku? 1. Nadace mají zpravidla nějaké poslání (např "podporovat rozvoj vědy a výzkumu v České republice, popularizovat vědu"). Do politických názory a podobných nesouvisející věcí donorů (legální podnikání) jim v principu spíš nic není ani být nemá.
MeSES odborná verze stanoviska k testování ve firmách. Pro obecnou odpověď na spory antigen-PCR doporučuju část "Souhrn existujícího výzkumu", založenou ne na osobních dojmech, ale stručném nezávislém shrnutí existujícího výzkumu.
V sérii textů "Co je třeba dělat" jsem popisoval co si myslím, že je třeba v Česku udělat. Drobná inventura co se zkutečně změnilo a co to znamená pro budoucnost.
Česko momentálně bojuje s epidemií covidu podle slavné "čtyřfázové strategie" hned na dvou frontách zároveň.
U opadající vlny delty jsme už ve fázi 4.
U vlny způsobené omikronem zatím zhruba ve fázi 2.
2. Také není pravda, že by na vysoký počet obětí COVID mělo jakkoli statisticky významný vliv např. hlášení autonehod nemocných s COVID. Na každou oběť autonehody s COVID započtenou do úmrtí na COVID připadá mnohem víc lidí, které sice zabil COVID, ale nejsou ve statistice.