Dvir Aran Profile
Dvir Aran

@dvir_a

6,015
Followers
657
Following
773
Media
6,287
Statuses

Biomedical Data Science Lab; Assistant Professor @ Technion, Israel.

Israel
Joined October 2009
Don't wanna be here? Send us removal request.
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
So to summarize, the vaccines are highly effective in preventing severe cases and probably also symptomatic diseases, even for those vaccinated early.
26
131
921
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
You’ve probably seen reports from Israel on low vaccine effectiveness in this wave. Is it because of Delta? Waning immunity? We think the reason is mostly that we got the denominator wrong.
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Are we seeing immunity waning in Israel? The MoH shared some raw data, and together with @geller_mic we tried to get a qualitative answer to this question. TL;DR – it seems that there is immunity waning, increasing risk of infection of early vaccinated by ~80%. ==>
15
87
194
19
280
798
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
מצרף את המצגת המלאה שהפצנו אמש וקצת רקע: לפני כשבוע הקמנו קבוצה של רופאים ומדענים מודאגים שמוטרדים שההחלטות המתקבלות לא תואמות את המודלים והמדע. דוגמא בולטת היא שלפי ההנחיות ניתן לעשות בדיקה שעה אחר חשיפה, לצאת שלילי ואין צורך בכל בידוד, למרות שברור שהבדיקה הזו חסרת ערך. >>
49
122
715
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Vaccine impact in Israel: changing trends. Analysis thread with @AArgoetti . From about a month and a half ago we are experiencing a new “Delta” burst. Cases are accumulating, and more and more severe patients are in the hospitals.
@AArgoetti
Amir Argoetti
3 years
שינוי מגמה בארץ - הגל ״תפס״ את הלא מחוסנים. @dvir_a ואנוכי הסתכלנו על המידע העדכני וניסינו לנתח את המידע הגולמי על מנת שנוכל להעריך טוב יותר את מצב התחלואה ואת יעילות החיסון. שרשור!🧵 >
25
61
436
20
244
676
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
This is what we got wrong. This “wave” started from cities with high vaccination rate and couldn’t “find” unvaccined adults at risk. The denominator we need to use until mid-July is >95% vaccination rate and not the country’s average.
12
83
547
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Just to correct one misconception from my thread - many of you understood that we think there is no waning immunity. This analysis does not reject the waning hypothesis, it just shows that the vaccines are still highly effective even with possible waning.
19
56
541
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
ראיתי פה ממש מעט על החדשות המדהימות שפורסמו בשבוע שעבר על הניסוי של GRAIL, וחשבתי שכדאי לכתוב על זה. לפני שבוע פורסמו התוצאות הסופיות של ניסוי קליני ענק שכלל 6,662 איש מעל גיל 50 לגילוי מוקדם של סרטן. בניסוי, ביצעו בדיקת דם שבודקת סמנים אפיגנטיים על דנ״א חופשי, >>
26
48
512
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
Prof. Abraham Lempel passed away this weekend at the age of 86. Prof. Lempel is known for the Lempel-Ziv compression algorithm, which is the base of the zip, gif and png formats. @TechnionLive
Tweet media one
7
106
436
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
״אי אפשר לעצור את האומיקרון. תראה את הולנד״
Tweet media one
47
43
425
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אני רק שאלה - התחזיות של מי מתממשות?
Tweet media one
18
21
387
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
See this graph. Until mid-July, the number (normalized to group size) of severe cases in the 65+ group was more or less similar between vaccined and unvaccined. This seemed troubling. But in the last 10 days trends have changed,
Tweet media one
24
108
390
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Finally, some data from Israel on vaccine effectiveness. Before we start, a couple of comments: 1. Almost all new infections in Israel are with the delta variant. 2. We don’t believe confirmed cases count since there are complicated incentives for testings.
Tweet media one
26
123
384
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
צריך לומר את זה במפורש - N12 שיחקו תפקיד מרכזי באווירה הציבורית שה״אומיקרון הוא חבר״, צינון שלא גורם למחלה קשה. הם המשיכו בכך לכל אורכו (״תם הטקס״ כבר חודש). איך אפשר לפרסם עכשיו ש״התחזיות מתממשות״?
16
23
372
@dvir_a
Dvir Aran
11 months
I'm going to try to articulate my thoughts regarding the removal of @mbeisen from the position of EiC at @eLife . This will be a long post, and I will probably regret it given the backlash. However, as an Israeli, we've grown accustomed to such reactions.
25
86
382
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Two weeks since we looked at new severe cases in Israel, time to check how trends have changed. As we predicted, the gap is widening... Now 20 per 1M new severe cases in vaxed group vs. 79 in the unvaxed (VE ~= 80%). How will it look in two weeks?
Tweet media one
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Vaccine impact in Israel: changing trends. Analysis thread with @AArgoetti . From about a month and a half ago we are experiencing a new “Delta” burst. Cases are accumulating, and more and more severe patients are in the hospitals.
20
244
676
16
106
336
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Super important data coming from Israel. Risk of severe COVID-19 for young individuals is much higher than the risk for myocarditis from the vaccine.
@yuvharpaz
Yuval Harpaz ♒
3 years
Myocarditis side effect (mild mostly) vs severe COVID19 as revealed by Israel MOH in a court appeal.
Tweet media one
34
157
441
28
146
327
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
מתווה הבידודים והבדיקות שיש כרגע בישראל מנותק מהמדע ופוגע בכלכלה. גם אוכלים את הדגים המסריחים וגם מגורשים מהעיר. פרסמנו היום מתווה בידוד 72 שעות אחרי חשיפה לכולם, כולל מחוסנים. >>
31
37
336
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
and now there are almost 3 times more daily new unvaccined severe cases. Looking at this plot, it seems that the R in the vaccined group is very close to 1, but in the last 10 days its almost 4 in the unvaccined group. We think its as expected with no mitigations beyond vaccines.
6
48
307
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
פרופ׳ מבורך זורק את האבן למים, ועכשיו גם אלף חכמים לא יצליחו להוציא אותה. בכל זאת, במאמר הזה של המנתח הראשי של פלורידה יש כל כך הרבה בעיות מתודולוגיות, שלצייץ עליו בלי להזכיר אותן זה חוסר אחריות. הנה כמה מהן, בקריאה מהירה:
@DrorMevorach
Dror Mevorach
2 years
מ.הבריאות בפלורידה הוציא הודעה שאינו ממליץ על חיסון mRNA כנגד קוביד לגברים בגילאים 18-39. ההודעה המפתיעה מתבססת על מחקר שנעשה בפלורידה ומצא סיכון יתר של מוות מסיבה קרדיאלית ב 28 יום לאחר החיסון באוכלוסיה זו. המימצא לא הופיע בחיסונים מסוג אחר. @idoefrati1
25
9
95
48
38
310
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
מכל ההנחיות המטומטמות שאנחנו מקבלים, אני חושב שזו המטומטמת מכולן (והתחרות קשה). למישהו יש הסבר מניח את הדעת לכך שאם הבדיקה בבית חיובית אז עושים מוסדית ואם היא שלילית אז ממשיכים כרגיל?
Tweet media one
61
11
307
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Myocarditis cases after vaccination in Israel after 1st, 2nd and 3rd dose. To date, with almost 3 million individuals vaccinated with a 3rd dose, only 1 myocarditis case.
24
87
304
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
The Israeli ministry of health provided today daily numbers of severe cases stratified by age and vaccination status. There are now ~13 severe cases per 100K for 60+ non-vaccinated individuals compared to 0.4 in the vaccinated group! (2.9 vs 0.1 in 40-60yo)
Tweet media one
15
110
289
@dvir_a
Dvir Aran
11 months
Suffering from the growing antisemitism at your university? We invite you to pursue your research and studies at the @TechnionLive
Tweet media one
11
76
276
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
@OdedRechavi @eLife Thanks Oded and all the others that have spoken up. Eisen has been using offensive language against Israelis for years, and early career scientists like me have been afraid to speak up because of fear of retaliation.
Tweet media one
1
32
266
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
The 3rd dose plot distributed yesterday had an error in it as identified by @_lewisy . I took the info in the graph on the 3rd dose and put it on the correct data. It still looks promising!
Tweet media one
@EricTopol
Eric Topol
3 years
This is the first look as to whether booster shots are working in people > 60 years old to suppress infections. Encouraging. Preliminary.
39
127
441
19
92
262
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
כמה החיסונים יעילים? גרסת הפרי-פרינט. אמלק: מאוד יעילים. 66-85% להדבקה, 87-96% למחל�� קשה. הנה שרשור קצר על האנליזה החדשה ==> לשרשור באנגלית -
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
Estimating real-world COVID-19 vaccine effectiveness in Israel! Now preprint version. TL;DR: Very effective. 66-85% for infection, 87-96% for severe disease. Below a tweetorial about this new analysis —>
10
91
241
11
39
254
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
Estimating real-world COVID-19 vaccine effectiveness in Israel! Now preprint version. TL;DR: Very effective. 66-85% for infection, 87-96% for severe disease. Below a tweetorial about this new analysis —>
10
91
241
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
לסיום, אנחנו לא חושבים שיהיה פה dooms day, אנחנו לא היסטריים, אנחנו לא תומכים בסגר. אנחנו מתריעים שהממשלה לא מנתחת את הנתונים נכון ופועלת תחת רצף של הנחות אנטי-מדעיות. בקבוצה חברים @BarakRaveh @HillaLeon @MDCaspi @chapnick @moranbar ועוד רבים וטובים.
22
17
244
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
שברנו את שיא העומס. לצערנו, הגל הזה עוד לא הגיע לשיא, כך שהשיא הזה ימשיך להשבר. זמן מצוין לבטל את הבידודים.
Tweet media one
23
23
239
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
אני משתף את השרשור הזה לא בגלל שזה קוביד כי מוצע ממזמן, אלא בגלל שזה פשוט סיפור נפלא (או יותר נכון מזעזע) על רמאות במדע. השרשור הזה צריך להיות הרצאה בקורס באתיקה מדעית. לפני כחצי שנה יצא מפלורידה מעין מאמר שעורר סערה רבתי, שטען שחיסונים גורמים לעליה באירועים לבביים אצל צעירים >>
@kmpanthagani
Kristen Panthagani, MD, PhD
1 year
You may recall Florida's vaccine analysis which claimed that mRNA vaccines are associated with increased risk of cardiac death in young men. This week, @TB_Times published earlier, unpublished drafts of that analysis. Those earlier drafts tell a dramatically different story...
Tweet media one
69
942
3K
16
34
232
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
שרשור על המצב ברוסיה. 1/24 סתם נו. בזמן שכולם עסוקים בהפיכה ברוסיה, חדשות מרגשות שמגיעות אלינו מכנס של האגודה האמריקאית לסכרת. חברת Vertex דיווחה על תוצאות מעקב אחרי חולים בסכרת סוג 1 שקיבלו את טיפול השתלת התאים VX-880. אמלק: החולים הבריאו. >>
12
16
229
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אז בעקבות הציוץ של @nadav_eyal ביום שישי ״זכיתי״ לחטוף את עוצמות הסחל׳ה של הטוויטר הישראלי. כיף. באמת מבאס שאנשים מרשים לעצמם להתבטא בצורה כזו ומשתמשים בתיבת תהודה עצמית כדי להוריד את רמת השיח לרמות תחתית. זה לא משהו שלא ידעתי, רק שזה באמת שונה שזה מכוון אליך.
27
14
228
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אני לתומי חשבתי שהויכוח עם פרופ׳ סגל הוא ויכוח מדעי - מה חוזים המודלים, מה סף הספיקה של המערכת, מה ההשפעה של NPIs וכדומה. עכשיו אני מבין שזה הכל קמפיין פוליטי: ״הקשבנו למומחים, קיבלנו החלטות קשות. ניצחנו ומנענו סגר״. העובדות כלל לא חשובות בקמפיין פוליטי, ולכן כל הויכוח עקר.
@Ayelet__Shaked
איילת שקד Ayelet Shaked
3 years
בתחילת מגפת האומיקרון, נאלצנו לקבל הכרעות קשות בחוסר ודאות ונעזרנו רבות בתחזיות שהראה לנו בקבינט פרופסור ערן סגל: עד 1200 חולים קשים ושלא נגיע לאי ספיקה. הוא הסביר שההגבלות לא יעזרו עם מקדם הדבקה כל כך גבוה. הסבריו ודרך החישוב שלו בהחלט הניחו את דעתי. הוא צדק בכל מילה.
353
14
294
23
16
223
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
So why does it look like there is no difference until mid-July? @AArgoetti looked at the trends of cases in cities stratified by their vaccination rates.
Tweet media one
5
22
221
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
כנראה שהיה זינוק באוכלוסית המבוגרים השנה, אחרת אני לא יודע להסביר מה קרה שכל כך הרבה מתו בשבוע ה-5 של השנה.
Tweet media one
21
15
214
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
The conclusion from this is that vaccinated patients are improving much more rapidly from severe disease. End.
21
29
214
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
זה וואו. בסופ״ש פורסם פרה-פרינט של חוקר מסטנפורד עם תוצאה יוצאת דופן בעלת משמעויות נרחבות - חיסון לשלבקת חוגרת מוריד את הסיכון לפתח אלצהיימר ב-20%! יש המון דברים מעניינים במחקר הזה - קשר בין וירוסים להתפתחות מחלות, שימוש במידע עולם אמיתי לסיבתיות ומשמעויות קליניות (וכלכליות?) >>
@PGeldsetzer1
Pascal Geldsetzer
1 year
Biggest thing to ever come out of my little group. Pls help spread this finding! We found clean, CAUSAL evidence that the shingles vaccine prevents a good chunk of dementia cases. So, could a virus cause Alzheimer’s->YES! Hear me out & see preprint: 🧵1/
Tweet media one
335
4K
13K
14
12
216
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
עדכון אופטימי לראשון בבוקר: הנתונים על מספר המאומתים עודכנו אחורה (כנראה שהיתה בדשבורד טעות בחלוקה למחוסנים ולא מחוסנים). לאחר העדכון אפשר לראות שנמשכת ירידה משמעותית אצל המחוסנים ב״קצב העליה״. עוד קצת מאמץ ואצל המחוסנים המבוגרים ה-R יהיה קטן מ-1.
Tweet media one
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
גרסא מעודכנת של שלושה ימים נוספים ל-R למחוסנים ולא מחוסנים מגיל 60+. ציפיתי להמשיך לראות ירידה אצל המחוסנים ככל שיש יותר כאלו שקיבלו בוסטר, אבל זה לא המצב. מה קורה פה?
Tweet media one
20
7
24
23
24
206
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
ביממה האחרונה 3 מקרי PIMS בילדים צעירים. PIMS מגיע כ3-4 שבועות לאחר ההבראה. לפני חודש היו כ-500 ילדים מאומתים ביממה מתחת לגיל 11. בשבוע האחרון היו בכל יום מעל 15000 ילדים מאומתים. מה כבר יכול להשתבש?
@meravcohenh
מירב כהן
3 years
עוד מקרה של pims: במחלקת ילדים בסורוקה מאושפזת ילדה בת 3.5 שהיתה חיובית לקורונה וסובלת כעת מתסמונת pims. הילדה הגיעה בתחילת השבוע למלר"ד ילדים בסורוקה, במצב קשה שהצריך תמיכה נשימתית. מצבה כעת השתפר משמעותית ומוגדר קל- בינוני.
5
3
41
20
26
203
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Are we seeing immunity waning in Israel? The MoH shared some raw data, and together with @geller_mic we tried to get a qualitative answer to this question. TL;DR – it seems that there is immunity waning, increasing risk of infection of early vaccinated by ~80%. ==>
15
87
194
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
ביום ראשון בערב נפגשנו עם השרה פרקש-הכהן. השרה היתה קשובה, אבל הבנו מהפגישה שהמידע שהשרים מקבלים ועל פיו מקבלים את ההחלטות חלקי ולא תואם את המציאות. התפתחה שם קונספציה שיהיו מלא נדבקים (יותר מ2 מליון), וזה מצוין. לא יהיה עומס בבתי חולים, לא יהיו חולים קשה. יאללה, חסינות עדר.
2
8
195
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
זהירות, שרשור ארוך. מתווה חסינות העדר: אחרי מתווה ההדבקות בכיתה (כיתה ירוקה בשמו המכובס), ביטול הבידודים למחוסנים שנחשפו למאומת, מתווה בדיקות האנטיגן לפני שאפשר לצאת חיובי, אתמול הגיע מתווה ההדבקות החדש – יציאת מאומתים מבידוד במנגנון שבו בין רבע לשליש עדיין מדבקים. >>
17
25
193
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אלו נתונים מדכאים במיוחד. בתחילת הגל סיפרו לנו הרופאים ש"נראה שהחולים הקשים כעת מעט פחות קשים מהחולים הקשים בגלים הקודמים - פחות מהם מונשמים ונכון לעכשיו גם פחות קורסים במהירות ופחות מתים". חודש וקצת אח״כ אנחנו רואים שיחס התמותה לחולים קשים נשאר זהה לגלים הקודמים (כ-25%).
@feldman_gil
Gil Feldman
3 years
והנה הנתונים בטבלה פשוטה. פעם מספרים מוחלטים, פעם % מסך הכל.
Tweet media one
1
5
31
6
20
190
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
נחשפנו למצגות שהוצגו לקבינט. התחזית שהוצגה שם דיברה על 2.4 מליון נדבקים עד סוף החודש. התחזית שהוצגה שם דיברה על 2 חולים קשה על כל אלף נדבקים. בחשבון פשוט מדובר על 6000 חולים קשה בשלושה שבועות. בגל הקודם גם היו 6000 חולים קשה, אבל ב-4 חודשים.
2
10
189
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אופציה ב׳: לא ידבקו כל כך הרבה, לא יהיה עומס. הלוואי, אבל שיהיה ברור שאז לא מדובר בגל קצר. לאופציה הזו כלל לא נערכים. כרגע הממשלה מקדמת בכל הכוח את אופציה א׳. לצערנו, אנחנו מבינים, שאין הבנה בממשלה מה המשמעות של האופציה הזו. זה הרקע למצגת שהפצנו.
1
6
190
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
עתידות (עוד שבוע): 1. ווהוו, איזה מדהים הבוסטר. תראו איך ההפרש בין חולים קשה מחוסנים ללא מחוסנים גדל. 2. אוי ויי, הבוסטר כושל. תראו כמה חולים יש שקיבלו בוסטר. (שני הדברים יקרו בודאות ללא קשר להצלחת הבוסטר)
10
6
188
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
שקף סיכום על המחיר של מדיניות ההכלה, והצורך בצמצום מגעים. לא סגר. צמצום. צמצום של 20% יוריד בחצי את העומס בבתי החולים.
Tweet media one
4
8
188
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
We can see that cities on the lower quartile had low number of cases until recently, but since mid-July, most cases are coming from those cities.
3
17
187
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
למה זה קורה לנו? למה יש פה גל רביעי? כשמסתכלים על התפשטות מחלה מסתכלים על ה-R האפקטיבי, כמה אנשים מדביק כל חולה. אחרי החיסונים הצלחנו להוריד את המספר הזה ל~0.7, וכך זה המשיך עד לכמעט אפס חולים. אז איך חזרנו ל-R~1.3? שרשור ארוך מדי על מחשבות שלי בנושא...
20
12
190
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
זה הבדל של שמים וארץ. ברור לכולם שמערכת הבריאות לא יכולה לעמוד בכך ויהיו המוני חולים שלא יקבלו טיפול ראוי. עכשיו, אי אפשר לאחוז את החבל בשתי קצותיו - אופציה א׳: יהיה גל קצר, תחזיקו מעמד שלושה שבועות וחוזרים לשגרה. רבע מהציבור ידבק ויהיה בסדר. אז לא. זו אחיזת עיניים.
2
7
185
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
האם יש תיאור מדויק יותר מזה לגל האומיקרון בישראל?
27
19
184
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
@EricTopol The reason why the delta wave is so troubling in Israel is not because of low vaccination rates, but because 90% of those vaccinations were 5+ months ago, and those have waned to low effectiveness.
Tweet media one
11
28
177
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
בשליש מהכיתות בישראל יש כרגע חולה מאומת. אני חוזר בשליש (!!!) מהכיתות יש לפחות חולה מאומת אחד.
Tweet media one
48
20
184
@dvir_a
Dvir Aran
8 months
🚨New preprint alert. GPT-4 has been shown to work well for diagnostics, but rarely as a clinical decision-support tool. In joint work with @ShellyShahar from @RambamHCC we used it to decide how to treat patients with stroke. How did it do? Amazingly well!
Tweet media one
15
49
194
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
כאמור, אנחנו לא פה להציע איך צריך לצמצם את ההדבקה. אבל יש מינימום, וזה בידוד לכולם (מחוסנים ולא מחוסנים) לאחר חשיפה ל-72 שעות. רק לאחר מכן יש ערך לבדיקת האנטיגן. עד אז זה סתם בזבוז כסף, זמן ומאמץ, ומיצר תחושת מוגנות מסוכנת.
Tweet media one
9
14
178
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
הנחות היסוד השגויות של מדיניות ההכלה. אומיקרון באמת וריאנט מאוד מדבק, אבל זה לא אומר שאי אפשר לצמצם את הנזק. כפי שאמר ידידי @BarakRaveh אפשר לסוע במהירות של 140 קמ״ש ולהגיע ליעד, אבל עדיף להאט. אומיקרון באמת פחות מסוכן, אבל המשך קצב ההדבקה הגבוה יגרום לעומס שלא הכרנו.
Tweet media one
1
6
170
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
האם אנחנו בשיא המאומתים ומפה תתחיל ירידה? עוד לא. הראשונים לרדת צריכים להיות המבוגרים 60+, בגלל הבוסטר וזהירות יתר. כך היה בכל הגלים. עדיין לא רואים ירידה בקבוצה זו. יציבות עם עליה מתונה, אבל עכשיו כשאנחנו יודעים שבוסטר 4 יעיל בכ-50% סביר שבשאר הגילאים אנחנו עדיין בעליה. >>
10
11
161
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
והתוצאות מדהימות! 92 איש קיבלו תוצאה חיובית, ול-35 מהם הסתבר שבאמת יש סרטן. זה PPV של 38% שזה בלתי נתפס, בטח ביחס למה שהיה עד היום. הבדיקה הזו, שנקראת Galleri, יכולה לזהות 50 סוגי סרטן שונים, וזה ממש גיים צ׳יינגר.
9
2
160
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
כמובן שיש עוד דרך ארוכה לעשות, אבל סביר מאוד שבשנים הקרובות המחיר של בדיקות כאלו ירד משמעותית ונוכל לעשות בדיקות כאלו כל שנה. יש גם את החשש לגילוי יתר של סרטן. אבל בכל מקרה, אלו חדשות מדהימות ונותנות תקווה רבה.
15
1
155
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
השמועות מספרות ששוב נושא הולנד עלה בקבינט היום. הטיעון - ״הסגר הכולל שננקט בהולנד לא סייע בהורדת התחלואה. האומיקרון התפשט בהולנד למרות הצעד המחמיר.״ אז הנה כמה גרפים מתוך @OurWorldInData , לשיפוטכם >>
14
14
154
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
בהמשך לשרשור שכתבתי אתמול על דנ״א עתיק - במאמר חדש חוקרים ריצפו שלדים מהמאה ה-12 שנמצאו בבור ליד נורוויץ׳, אנגליה. הם גילו שאלו יהודים שכנראה נרצחו בפוגרום ב-1190. מעבר לממצא הזה שפותרת את השאלה מי אלו השלדים הללו מאז נמצאו ב-2004, יש פה עוד ממצא מפתיע מאוד >>
@AsafRonel
Asaf Ronel
2 years
מחקר דנ"א עתיק מצא שקבר אחים עם שלדים של שישה מבוגרים ו11 ילדים מסוף המאה ה12 שנמצא בנורוויץ' שבאנגליה הוא כנראה של יהודים שנרצחו בפוגרום
2
1
42
4
4
157
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
בשעה טובה נראה שעברנו את שיא הגל במאומתים. אפשר לראות זאת במספר המבוגרים 60+ שאומתו היום, ולראשונה יש ירידה לעומת השבוע הקודם. אמנם ירידה קלה של רק 6%, שחלקה אולי מוסברת מיעילות הבוסטרים, ועדיין, נראה שהשיא כבר מאוחרינו. >>
13
15
152
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
והנה מספר האשפוזים. אצלנו חצינו כבר מזמן את סף הספיקה של מערכת הבריאות. אצלם יש יציבות. ככה אגב נראה ״שיטוח עקומה״. המטרה, בעולם של חיסונים,זה לא למנוע הדבקות, אלא למנוע קריסה של מערכת הבריאות.
Tweet media one
12
10
151
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אז מה אנחנו מציעים? אנחנו לא פוליטיקאים או אנשי מדיניות. מה בדיוק צריך לעשות זו אחריות של אחרים. אנחנו יכולים להראות שלפי המודלים, צמצום של 20% מהמגעים יקטין את העומס ב-50%. זה יאפשר למערכת לתת טיפול ראוי לכולם.
Tweet media one
2
5
150
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
גל האומיקרון שונה מגלים קודמים בגלל תחלואת הילדים. רואים את זה בכל העולם. 1 מכל 900 ילדים אושפז במצב בינוני\קשה\קריטי. בקצב הדבקה כל כך גבוה הרבה מאוד ילדים ידבקו, והרבה גם יגיעו לאשפוז. אין בישראל מספיק מיטות אשפוז ומיטות טיפול נמרץ לכל הילדים הללו שיגיעו במקביל.
Tweet media one
4
9
149
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
כבר כמה ימים שאני רוצה לכתוב פוסט מדכא במיוחד. לפני כמעט חודש פורסם מאמר שקיבל כותרות משועשעות מה - המאמר מצא ירידה ב-IQ אצל מחלימים מקורונה. גם אני קראתי את הכותרות וחשבתי שזה קשקוש, אבל אתמול קראתי את המאמר, והוא לא רע בכלל ומטריד מאוד =>
18
25
149
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
"אנחנו מודאגים מכך שהנרטיב שהשתלט בכמה מדינות שבגלל החיסונים, יכולת ההדבקה הגבוהה של האומיקרון והחומרה הנמוכה יותר, אין צורך יותר למנוע הדבקות. אין דבר שיכול להיות רחוק יותר מהאמת". (ארגון הבריאות העולמי) מוטב מאוחר מאשר אף פעם לא.
@WHO
World Health Organization (WHO)
3 years
@DrTedros "We’re concerned that a narrative has taken hold in some countries that because of 💉, and because of Omicron’s high transmissibility and lower severity, preventing transmission is no longer possible, and no longer necessary. Nothing could be further from the truth"- @DrTedros
29
623
1K
9
15
149
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
לפני שלושה שבועות בדיוק פרסמנו מצגת עם ההערכות למה שהולך לקרות פה עד סוף ינואר אם לא יהיה שינוי. שינוי לא היה, ולכן זמן טוב לראות איפה הערכות שלנו דייקו יותר ואיפה פחות. @HillaLeon @BarakRaveh @MDCaspi @chapnick @kvatinsky @moranbar >>
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
מצרף את המצגת המלאה שהפצנו אמש וקצת רקע: לפני כשבוע הקמנו קבוצה של רופאים ומדענים מודאגים שמוטרדים שההחלטות המתקבלות לא תואמות את המודלים והמדע. דוגמא בולטת היא שלפי ההנחיות ניתן לעשות בדיקה שעה אחר חשיפה, לצאת שלילי ואין צורך בכל בידוד, למרות שברור שהבדיקה הזו חסרת ערך. >>
49
122
715
12
25
148
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
המודל שהוצג לממשלה על 320 אלף נדבקים בעוד שבועיים ואז ירידה מהירה (הבהרה: לא המודל שלנו, המודל של הממשלה!). הבעיה היא שהמשמעות של זה לא הובהרה לשרים, להיפך. נאמר שיהיו פי 2 חולים מהגל הקודם, אבל חמישית מכמות החולים קשה. הטעות היא שחסר פה מימד הזמן - אז זה היה במשך 4 חודשים.
Tweet media one
5
9
146
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
הבדיקה מגלה את המחלה בשלבים מאוד מוקדמים, שבהם הטיפולים מאוד אפקטיביים. היא גם מגלה את המחלה בסוגי סרטן שאין בהם בכלל בדיקה רוטינית (כמו ממוגרפיה ודם בצואה) ולכן מזוהות בדרך כלל בשלבים מאוחרים מדי (למשל סרטן לבלב).
1
3
146
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
How effective are the COVID-19 vaccines? Israel was early to vaccinate its population (~1/3 of pop now with the @Pfizer @BioNtech vaccine) and real-wold data is starting to accumulate. However, as we are learning, calculating efficacy from RWD is complicated. A thread =>
3
49
148
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
אז אומרים לנו, אי אפשר לצמצם מגעים כשאומיקרון כל כך מדבק. אז זהו, אומיקרון לא הרבה יותר מדבק מדלתא, הוא פשוט מדביק מהר יותר. צמצום מגעים אפשרי בדיוק כמו בגלים הקודמים ויתן אפקט דומה.
Tweet media one
6
8
146
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
What an amazing day for Israeli science. 3 ground-breaking studies published yesterday in @nature are coming from Israel. Diverse topics: growing babies in an artificial womb, bacteria messing up our immune system in cancer, a computer that can debate... Kudos to all 👏👏👏
1
27
147
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
למעשה, אתם יכולים להיכנס היום לבית מרקחת בארה״ב ולרכוש בדיקה כזו במחיר של $949 בלבד. כבר כמעט 40 אלף אמריקאים עשו את הבדיקה על חשבונם, ו1.1% מתוכם קיבלו תוצאה חיובית, בשלבים מאוד מוקדמים של המחלה.
Tweet media one
2
2
142
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
תוכנית בנט למלחמה באומיקרון: לשטח את העקומה, אבל על ציר ה-y במקום על ציר ה-x.
4
5
139
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
זו הסיבה העיקרית שבגללה יצאנו לדרך לפני כשבועיים. כשדיברנו עם נציגי הממשלה נאמר לנו שהנחת העבודה היא על בסיס תחזית שעד סוף ינואר הגל הזה יסתיים ולכן גם אם המערכת תקרוס, זה יהיה לזמן קצר. פשוט צריך נשימה עמוקה, ואחרי זה הכל יסתיים. הנחת העבודה הזו היתה שגויה. >>
@MDCaspi
Oren Caspi 🎗️
3 years
ועוד נקודה, שאין להקל בה ראש, ודינה הוא בתחזיות ובדיוק בהן. הבסיס למדיניות המממשלה היה צפי לסיום הגל תוך 4 שבועות לאור תרחישים שהוצגו לה. הערב, אני שומע שהתחזית שונתה ושהגל לא יסתיים בסוף ינואר אלא בסוף פברואר. משמעות המשך היא פגיעה אנושה בבריאות של כולנו. בול פגיעה.
0
7
127
11
16
141
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
Thank you for all your support over the last couple of days. I've received kind words of support from colleagues from all around the world, but also encountered some really infuriating comments. Here are a few, along with my responses: >>
3
27
137
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
בהולנד היו 12 אלף מאומתים ב-25 בדצמבר. בשבועיים מאז הם עלו ל-28 אלף. פי 2.3. בישראל ב-25 בדצמבר היו 1500 מאומתים, היום 54 אלף. פי 36. בהולנד חיים פי שניים תושבים מישראל.
@segal_eran
Eran Segal
3 years
ישראל והולנד עם מספר מאומתים דומה וקצב עליה דומה בהולנד הוכרז סגר ב-19 לדצמבר. אין לי נתונים עד כמה הוא בוצע או נאכף פרטי הסגר:
Tweet media one
51
22
218
18
15
131
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Congrats to all the winners of the Israel Science Foundation (ISF) grants, me included 😀
12
0
130
@dvir_a
Dvir Aran
2 years
אדנדום: בגלל שהנושא חוזר - כתבתי שזה ניתן לרכישה בבית מרקחת, אבל זה לא. צריך מרשם מרופא בשביל זה. התכוונתי לומר שזה נגיש כבר יותר משנה, ובאמת כל אחד מעל גיל 50 יכול לקבל את המרשם ולעשות את הבדיקה (בהנחה שמוכן לוותר על ~אלף דולר). סביר מאוד שבעקבות פרסום התוצאות יהיה מחסור.
6
0
132
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
לפני שלושה שבועות אמרו לנו שאי אפשר לעשות כלום מול אומיקרון כי אפילו אצל הולנד שבסגר לא מצליחים להשתלט על אומיקרון. אבל הסגר שלהם כן היה אפקטיבי וכשהם התחילו להוריד מגבלות ופתחו בתי ספר הכל השתחרר כצפוי. זה מוכיח שניתן לצמצם את ההאצה של אומיקרון, בדיוק כמו שטענו.
6
13
129
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
לצערנו אומיקרון מדביק גם מחוסנים. לפי המתווה הנוכחי, ניתן לבצע בדיקת אנטיגן מיד לאחר חשיפה. זו בדיקה חסרת ערך, בזבוז זמן בעמידה בתור. היא גם מייצרת ביטחון כוזב לנבדק ורק מגבירה את ההדבקות סביבנו. מחקרים הראו שרק לאחר 72 שעות מההדבקה יש סיכוי לקבל תוצאה חיובית בבדיקת אנטיגן.
Tweet media one
3
5
128
@dvir_a
Dvir Aran
1 year
I had low expectations, so I don't feel betrayed. What our colleagues must understand is that the 7/10 massacre is a tectonic event for Israelis and Jews worldwide. While in the past we might have turned a blind eye to various forms of antisemitism, we won't tolerate it anymore.
@OdedRechavi
Oded Rechavi
1 year
I'm confident that I reflect the opinion of most of my friends in Israeli academia when I say that we feel betrayed by many of our colleagues abroad and will never forget #hamasiISIS
133
458
3K
5
14
120
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
Waning immunity, take 2. More data from MoH. The plot speaks for itself. X-axis is the week of vaccination, y-axis is the relative risk for infection in last two weeks. Data suggests that early vaxxed risk for infection is doubled compared to late vaccinated. With @geller_mic .
Tweet media one
21
37
116
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
ראשית, אנחנו חושבים שהדבקה המונית מסוכנת לבריאות הציבור ומערכת הרפואה. בנוסף, היא גם מסכנת את הכלכלה שלא יכולה לתפקד בהדבקה המונית. אם אתם חושבים אחרת, אז כל זה לא רלוונטי עבורכם. מסיבת הדבקה מהנה.
2
3
119
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
🔥🔥 Excited to share our new pre-print by @HillaLeon : “Over- and under-estimation of vaccine effectiveness”. Can different dynamics between vaccinated and unvaccinated people affect vaccine effectiveness (VE) estimations?
6
28
121
@dvir_a
Dvir Aran
5 years
Its out! Our SingleR package for reference-based scRNA-seq annotation is now on @Bioconductor . Improved speed, new functionalities, new references, new vignettes and more. Amazing work led by Aaron Lun and Daniel Bunis, Jared Andrews & Friederike Dündar!
0
37
118
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
@EricTopol @OurWorldInData This is not the reason. Our adult population is 90%+ vaccinated, and they are the ones that are flooding ICUs. The reason is the uncontrolled spread of omicron in Israel spearheaded by government, under false belief that if we let it spread fast it will end fast.
10
21
112
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
לא אוהב להיכנס לפוליטיקה, אבל זה באמת חוסר הבנה מוחלט ועיוות של הנתונים. 1. במהלך אפריל-מאי היינו בחסינות עדר, ולכן הפתיחה היתה לגיטימית (ומקובלת על כולם). במאי בכלל לא היו הדבקות בקהילה בישראל. לזה שדלתא חדר באותה תקופה יש 0 רלוונטיות. =>
@BenCaspit
Ben Caspit בן כספית
3 years
חתן פרס הקשקשן הפאתטי להיום. הדלתא חדר לכאן במרץ, התפשט באפריל והמריא במאי. הכל תחת הממשלה הקודמת, שבמקביל פתחה הכל, חיזלשה והודיעה על סיום הקורונה. רצ"ב גרפים של משרד הבריאות להמחשה (באדיבות @LittleMoiz )
Tweet media one
Tweet media two
86
37
539
12
15
110
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
מי שצריך לראות את זה ויזואלית, הנה הערכה של ההשפעה של צמצום מגעים. אי הודאות ענקית, וקשה מאוד להעריך כמה חולים באמת יהיו. המודלים של הממשלה חמורים אפילו מאלה שפה, גם במודלים אופטימיים זה לא נראה טוב בלי פעולות של הממשלה.
Tweet media one
1
6
114
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
נתונים מעניינים על החוזרים מאוקראינה מ- @LittleMoiz . בסך הכל בחודש האחרון חזרו 34,970 ישראלים מאוקראינה (רובם אחרי ביקור באומן), מתוכם כמעט 10% קיבלו תוצאה חיובית לקורונה מהנחיתה ועד 10 ימים לאחר מכן. כמה תובנות >>
Tweet media one
8
9
115
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
במודלים שהוצגו לקבינט מעריכים שבעוד שבועיים יהיו 300 אלף מאומתים ביממה. המפתח שהוצג בממשלה הוא 2 חולים קשה לכל 1000 מאומתים. בחישוב פשוט זה 600 חולים קשה ביממה! אגב, המסקנה שהוצגה לקבינט - אל דאגה, יהיו מעט חולים.
20
12
114
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
בקיצור, זה כבר לא עניין מדעי. הכעס הוא על הפער שנפער בין הממשלה לציבור. ההתנערות מאחריות מכעיסה אותי בתור אזרח אבל לא בתור מדען. התוצאה של הגבלות וולנטריות והגבלות חוקיות זהה מהבחינה הזו. בכל מקרה, זה כבר נושא למומחים אחרים. שיהיה לנו בהצלחה!
9
2
114
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
2. מדד התנועה של גוגל (מ- @_lewisy ). מספר האנשים שנשארים בבית עכשיו זהה למה שהיה בשבוע של ראש השנה.
Tweet media one
3
11
110
@dvir_a
Dvir Aran
4 years
@MaxCRoser @ewanbirney These numbers are ~two weeks old. We now have over 2 million fully vaccinated, and at least 39 of them have died.
17
18
114
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
ולסיום, כמובן גאה להיות חלק מקבוצה של אנשים שאיכפת להם וחושבים שאסור לוותר במלחמה בנגיף.
@MDCaspi
Oren Caspi 🎗️
3 years
ובהזדמנות הזו תודה לחבורה המופלאה שיש לי הזכות להיות חלק ממנה @BarakRaveh @dvir_a @moranbar @chapnick @_lewisy @erlichya @shahar @HillaLeon @kvatinsky
2
1
71
6
1
113
@dvir_a
Dvir Aran
7 years
Finally! Super excited to share that xCell - the most accurate cell type enrichment analysis method from bulk transcriptomes - is now officially published in @GenomeBiology with @atulbutte and @hzc363 at @UCSF -
Tweet media one
5
84
108
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
נראה לי שהחשיבות של אי חציית סף הספיקה לא מספיק ברורה. מערכת הבריאות שלנו מסוגלת להתמודד עם כמות מסוימת של חולים קשה. מעבר לזה איכות הטיפול יורדת באופו הדרגתי. כתוצאה מכך, כאשר חוצים סף מסוים, התמותה מזנקת. זה קרה לנו בגל 3, זה קרה לנו גם בגל הזה. >>
Tweet media one
9
11
110
@dvir_a
Dvir Aran
3 years
ביננתיים המודל היחיד שבכיוון הוא המודל של @HillaLeon . לצערנו, אין לנו את המומחיות למדל קשיים בהבנת הנקרא.
Tweet media one
@klshw
מגיבה כלשהי
3 years
לפני 10 ימים פרסם נדב איל שקבוצה של חוקרים הציגו שיהיו כאן 320 אלף נדבקים ביום, וטעות נגררת של 600 חולים קשים ביממה. אני חושבת שהגיע הזמן להגיד - אתם קלולסים גמורים. דביר ארן, גיל צ'פניק, הילה דה ליאון, ברק רווה, אורן כספי ועו"ד מורן לשם בר. אתם לא שווים את תואר הד"ר שהוצמד לכם.
6
9
66
6
7
110